Table 1. Sequence identity matrix for the replication-associated protein sequence (%). Cameroonian swine (KM392284–KM392286) and Madagascan human cycloviruses (KM392287–KM392289) described in this study are bolded. Vietnamese VN strains are colored in grey, Malawian VS5700009 in light yellow and Tunisian TN25 and TN18 appear in orange¹,⁷,⁸.

	KM392285	KM392284	KM392286	KM392289	KM392288	KM392287
KM392285		100	100	93,5	93,5	93,5
KM392284	100		100	93,5	93,5	93,5
KM392286	100	100		93,5	93,5	93,5
KM392289	93,5	93,5	93,5		100	99,3
KM392288	93,5	93,5	93,5	100		99,3
KM392287	93,5	93,5	93,5	99,3	99,3
KF031465	93,5	93,5	93,5	97,6	97,6	97,6
KF031467	93,5	93,5	93,5	97,6	97,6	97,6
KF031468	93,5	93,5	93,5	97,6	97,6	97,6
KF031469	93,5	93,5	93,5	97,6	97,6	97,6
NC_021707	93,5	93,5	93,5	97,6	97,6	97,6
KF031470	93,5	93,5	93,5	98,3	98,3	98,3
KF031471	93,5	93,5	93,5	98,6	98,6	98,6
KF031466	93,1	93,1	93,1	97,9	97,9	97,9
KC771281	77,4	77,4	77,4	77,1	77,1	76,3
NC_021568	77,4	77,4	77,4	77,1	77,1	76,3
GQ404857	73,6	73,6	73,6	72,7	72,7	72,7
GQ404858	74,3	74,3	74,3	73,4	73,4	73,1
HQ738635	71,7	71,7	71,7	70,5	70,5	70,5
NC_014927	71,7	71,7	71,7	70,5	70,5	70,5
HQ738634	71,3	71,3	71,3	70,1	70,1	70,1
HQ738636	50,5	50,5	50,5	48,8	48,8	49,1
NC_014928	50,5	50,5	50,5	48,8	48,8	49,1
GQ404844	49,5	49,5	49,5	47,3	47,3	47,7
GQ404846	50,7	50,7	50,7	48,6	48,6	48,9
GQ404848	50,7	50,7	50,7	48,6	48,6	48,9
GQ404849	48,2	48,2	48,2	45,4	45,4	45,8
GQ404850	47,9	47,9	47,9	45,1	45,1	45,4
HQ738644	49,3	49,3	49,3	48,6	48,6	49,3
NC_014930	49,3	49,3	49,3	48,6	48,6	49,3
HQ738643	49,6	49,6	49,6	48,9	48,9	49,6
KC512919	50,7	50,7	50,7	48,8	48,8	48,8
GQ404847	52,7	52,7	52,7	50,2	50,2	50,5
KC512916	50,4	50,4	50,4	48,6	48,6	48,9
HQ638063	50,7	50,7	50,7	50,2	50,2	49,8
HQ638066	50,7	50,7	50,7	49,8	49,8	49,5
HQ638060	50,7	50,7	50,7	50,5	50,5	50,2
GQ404845	52	52	52	49,8	49,8	50,2
HQ738637	51,8	51,8	51,8	51,8	51,8	51,4
NC_014929	51,8	51,8	51,8	51,8	51,8	51,4
GQ404854	51,8	51,8	51,8	50,2	50,2	50,9
JF938081	49,8	49,8	49,8	48,8	48,8	49,1
HM228874	50,7	50,7	50,7	49,8	49,8	49,5
JF938079	50	50	50	48,6	48,6	48,9
JX185426	49,8	49,8	49,8	49,1	49,1	49,5
NC_023866	49,8	49,8	49,8	49,1	49,1	49,5
JX569794	44,8	44,8	44,8	43,7	43,7	44
NC_020206	44,8	44,8	44,8	43,7	43,7	44
GQ404855	52,5	52,5	52,5	50,4	50,4	50,7
KF726986	50	50	50	49,6	49,6	50
KF726984	50	50	50	49,6	49,6	50
NC_023874	50	50	50	49,6	49,6	50
KF726987	50	50	50	49,6	49,6	50
KF726985	50	50	50	49,6	49,6	50
NC_023869	50,7	50,7	50,7	50	50	50
KM017740	40,1	40,1	40,1	39,4	39,4	39,4
JX260426	11	11	11	11	11	10,7