Table 2. Sequence identity matrix for the Capsid protein sequence (%). Cameroonian swine (KM392284–KM392286) and Madagascan human cycloviruses (KM392287–KM392289) described in this study are bolded. Vietnamese VN strains are colored in grey, Malawian VS5700009 in light yellow and Tunisian TN25 and TN18 appear in orange¹,⁷,⁸.

	KM392288	KM392289	KM392287	KM392285	KM392286	KM392284
NC_021568	35,3	35,3	35,3	34,1	34,1	34,1
KC771281	35,3	35,3	35,3	34,1	34,1	34,1
KF031470	97,7	97,7	97,3	83,8	83,8	83,8
KF031471	97,7	97,7	97,3	83,8	83,8	83,8
KF031469	98,6	98,6	98,2	84,2	84,2	84,2
KF031468	98,6	98,6	98,2	84,2	84,2	84,2
KF031467	98,6	98,6	98,2	84,2	84,2	84,2
NC_021707	98,6	98,6	98,2	84,2	84,2	84,2
KF031465	98,6	98,6	98,2	84,2	84,2	84,2
KF031466	98,2	98,2	98,6	84,2	84,2	84,2
KM392288		100	98,6	84,7	84,7	84,7
KM392289	100		98,6	84,7	84,7	84,7
KM392287	98,6	98,6		84,2	84,2	84,2
KM392285	84,7	84,7	84,2		100	100
KM392286	84,7	84,7	84,2	100		100
KM392284	84,7	84,7	84,2	100	100
GQ404857	48	48	47,5	48	48	48
GQ404858	47,5	47,5	47,1	47,5	47,5	47,5
HQ738635	49,3	49,3	49,8	47,9	47,9	47,9
NC_014927	49,3	49,3	49,8	47,9	47,9	47,9
HQ738634	49,3	49,3	49,8	47,9	47,9	47,9
KF726987	22,8	22,8	22,4	23,8	23,8	23,8
KF726986	22,8	22,8	22,4	23,8	23,8	23,8
KF726984	22,8	22,8	22,4	23,8	23,8	23,8
NC_023874	22,8	22,8	22,4	23,8	23,8	23,8
KF726985	22,8	22,8	22,4	23,8	23,8	23,8
HQ638060	24,9	24,9	24,9	24,5	24,5	24,5
HQ638066	24,5	24,5	24,5	24	24	24
HQ638063	25,3	25,3	25,3	25,8	25,8	25,8
KC512916	24,1	24,1	24,6	24,6	24,6	24,6
GQ404847	25,4	25,4	25,4	24,1	24,1	24,1
NC_020206	19,7	19,7	19,2	19,7	19,7	19,7
JX569794	19,7	19,7	19,2	19,7	19,7	19,7
GQ404844	19	19	19	19,5	19,5	19,5
GQ404854	22,2	22,2	22,2	22,2	22,2	22,2
HM228874	17,3	17,3	17,3	16,5	16,5	16,5
GQ404845	18,7	18,7	18,7	19,2	19,2	19,2
GQ404855	17,2	17,2	17,2	16,8	16,8	16,8
HQ738636	22,6	22,6	22,2	23,6	23,6	23,6
NC_014928	22,6	22,6	22,2	23,6	23,6	23,6
KC512919	23,8	23,8	23,4	22,6	22,6	22,6
JF938081	23,2	23,2	23,2	23,3	23,3	23,3
HQ738644	20,4	20,4	20,4	22,6	22,6	22,6
NC_014930	20,4	20,4	20,4	22,6	22,6	22,6
HQ738643	20,4	20,4	20,4	22,6	22,6	22,6
GQ404850	21,3	21,3	21,3	21,3	21,3	21,3
GQ404849	21,3	21,3	21,3	21,3	21,3	21,3
JF938079	23,5	23,5	23	22,6	22,6	22,6
NC_023866	21,7	21,7	20,9	22,1	22,1	22,1
JX185426	21,7	21,7	20,9	22,1	22,1	22,1
HQ738637	20,9	20,9	20,9	20,9	20,9	20,9
NC_014929	20,9	20,9	20,9	20,9	20,9	20,9
GQ404848	23,8	23,8	23,4	22,1	22,1	22,1
GQ404846	23,4	23,4	22,9	21,6	21,6	21,6
NC_023869	24,2	24,2	23,7	24,7	24,7	24,7
KM017740	18,7	18,7	18,7	17,4	17,4	17,4
JX260426	6,6	6,6	6,6	7,5	7,5	7,5