Skip to main content
. 2017 Jan 12;9(2):266–278. doi: 10.1093/gbe/evw293

Table 2.

Estimated dS, dN, and dN/dS for LFY, PHYC, and TOR Genes

Sugarcane × Sorghum
Sugarcane × Rice
Gene BACs dS dN dN/dSa dS dN dN/dSa
TOR 007C22 0.064 0.007 0.108 0.545 0.033 0.060
030H10 0.062 0.008 0.124 0.551 0.033 0.060
102H05 0.061 0.008 0.126 0.556 0.033 0.060
187L21 0.062 0.007 0.116 0.554 0.033 0.060
043C15 0.070 0.005 0.075 0.568 0.031 0.054
156D23 0.069 0.005 0.071 0.569 0.030 0.053
Average 0.065 0.007 0.103 0.557 0.032 0.058
σ 0.004 0.001 0.022 0.009 0.001 0.003
PHYC 038J02 0.066 0.014 0.206 0.414 0.056 0.136
056J11 0.070 0.013 0.183 0.418 0.055 0.132
095E16 0.077 0.014 0.187 0.414 0.056 0.136
173M11 0.075 0.014 0.190 0.414 0.056 0.136
Average 0.072 0.014 0.192 0.415 0.056 0.135
σ 0.004 0.000 0.009 0.002 0.000 0.002
LFY 011C13 0.087 0.008 0.097 0.290 0.072 0.249
015P19 0.096 0.012 0.123 0.302 0.073 0.240
070I10 0.093 0.009 0.101 0.302 0.075 0.249
202G24 0.089 0.012 0.132 0.296 0.073 0.245
239D06 0.095 0.013 0.135 0.308 0.073 0.236
236J21 0.085 0.013 0.158 0.285 0.076 0.267
253I01 0.076 0.010 0.127 0.287 0.068 0.235
Average 0.089 0.011 0.125 0.296 0.073 0.246
σ 0.006 0.002 0.019 0.008 0.002 0.010
a

All dN/dS values are statistically significant for purifying selection (dN/dS ≪ 1; Z-test P-value = 0).