Table 1.
Genome summary of Lactobacillus casei group.
| Organism/name | Strain | Clade | Assembly level | Size (Mb) | GC% | GC group |
|---|---|---|---|---|---|---|
| L. casei LC5 | LC5 | L. casei | Complete genome | 3.13 | 47.9 | High |
| L. casei str. Zhang | Zhang | L. casei | Complete genome | 2.90 | 46.4 | Low |
| L. casei BL23 | BL23 | L. casei | Complete genome | 3.08 | 46.3 | Low |
| L. casei BD-II | BD-II | L. casei | complete genome | 3.13 | 46.3 | Low |
| L. casei LC2W | LC2W | L. casei | Complete genome | 3.08 | 46.4 | Low |
| L. casei 12A | 12A | L. casei | Complete genome | 2.91 | 46.4 | Low |
| L. casei W56 | W56 | L. casei | Complete genome | 3.13 | 46.3 | Low |
| L. casei LOCK919 | LOCK919 | L. casei | Complete genome | 3.14 | 46.2 | Low |
| L. casei subsp. casei ATCC 393 | ATCC 393 | L. casei | Complete genome | 2.95 | 47.9 | High |
| L. casei LcY | LcY | L. casei | Chromosome | 3.10 | 46.3 | Low |
| L. casei LcA | LcA | L. casei | Chromosome | 3.13 | 46.3 | Low |
| L. casei A2-362 | A2-362 | L. casei | Scaffold | 3.19 | 46.2 | Low |
| L. casei | KL1-Liu | L. casei | Scaffold | 2.85 | 46.6 | Low |
| L. casei DSM 20011 = JCM 1134 | DSM 20011 | L. casei | Scaffold | 2.82 | 46.5 | Low |
| L. casei 21/1 | 21/1 | L. casei | Contig | 3.22 | 46.2 | Low |
| L. casei 32G | 32G | L. casei | Contig | 3.01 | 46.4 | Low |
| L. casei A2-362 | A2-362 | L. casei | Contig | 3.36 | 46.1 | Low |
| L. casei CRF28 | CRF28 | L. casei | Contig | 3.04 | 46.3 | Low |
| L. casei M36 | M36 | L. casei | Contig | 3.15 | 46.3 | Low |
| L. casei T71499 | T71499 | L. casei | Contig | 3.00 | 46.2 | Low |
| L. casei UCD174 | UCD174 | L. casei | Contig | 3.07 | 46.4 | Low |
| L. casei UW1 | UW1 | L. casei | Contig | 2.87 | 46.4 | Low |
| L. casei UW4 | UW4 | L. casei | Contig | 2.76 | 46.4 | Low |
| L. casei Lc-10 | Lc-10 | L. casei | Contig | 2.95 | 46.4 | Low |
| L. casei Lpc-37 | Lpc-37 | L. casei | Contig | 3.08 | 46.3 | Low |
| L. casei UW4 | UW4 | L. casei | Contig | 2.63 | 46.4 | Low |
| L. casei 12A | 12A | L. casei | Contig | 2.93 | 46.3 | Low |
| L. casei 5b | 5b | L. casei | Contig | 3.02 | 46.3 | Low |
| L. casei | N87 | L. casei | Contig | 3.00 | 47.9 | High |
| L. casei | 867_LCAS | L. casei | Contig | 3.09 | 47.9 | High |
| L. casei | DPC6800 | L. casei | Contig | 3.05 | 46.4 | Low |
| L. casei | Lc1542 | L. casei | Contig | 2.92 | 46.5 | Low |
| L. casei | 1316.rep1_LPAR | L. casei | Scaffold | 2.86 | 46.5 | Low |
| L. casei | 1316.rep2_LPAR | L. casei | Scaffold | 2.79 | 46.4 | Low |
| L. casei | 844_LCAS | L. casei | Scaffold | 2.79 | 46.4 | Low |
| L. casei | BM-LC14617 | L. casei | Scaffold | 3.04 | 46.3 | Low |
| L. casei | Lbs2 | L. casei | Scaffold | 3.27 | 47.9 | High |
| L. casei DSM 20011 = JCM 1134 | JCM 1134 | L. casei | Contig | 2.78 | 47.7 | High |
| Lactobacillus paracasei ATCC 334 | ATCC 334 | L. paracasei | Complete genome | 2.92 | 46.6 | Low |
| L. paracasei subsp. paracasei 8700:2 | 8700:2 | L. paracasei | Complete genome | 3.03 | 46.3 | Low |
| L. paracasei N1115 | N1115 | L. paracasei | Complete genome | 3.06 | 46.5 | Low |
| L. paracasei subsp. paracasei JCM 8130 | JCM 8130 | L. paracasei | Complete genome | 3.02 | 46.6 | Low |
| L. paracasei | CAUH35 | L. paracasei | Complete genome | 2.97 | 46.3 | Low |
| L. paracasei | L9 | L. paracasei | Complete genome | 3.08 | 46.3 | Low |
| L. paracasei | KL1 | L. paracasei | Complete genome | 2.92 | 46.6 | Low |
| Lactobacillus zeae DSM 20178 = KCTC 3804 | DSM 20178 | L. zeae | Scaffold | 3.12 | 47.7 | High |
| Lactobacillus rhamnosus GG | GG (ATCC 53103) | L. rhamnosus | Complete genome | 3.01 | 46.7 | Low |