Skip to main content
. 2017 Apr 18;5:e3139. doi: 10.7717/peerj.3139

Table 7. CASP 11 results comparison.

Specificity results on the 105 CASP 11 targets for short-range, medium-range, and long-range contacts with guess numbers of L/10, L/5, and L/2 where L is the protein length.

Method Seq. sep. of [6,12] Seq. sep. of (12,24] Seq. sep. of >24
L/10 L/5 L/2 L/10 L/5 L/2 L/10 L/5 L/2
Markov networks 0.287 0.254 0.197 0.270 0.235 0.195 0.142 0.127 0.108
CoinDCA 0.452 0.391 0.286 0.430 0.365 0.254 0.279 0.240 0.186
PSICOV 0.190 0.144 0.112 0.196 0.163 0.115 0.198 0.172 0.127
plmDCA 0.185 0.144 0.107 0.208 0.165 0.122 0.226 0.214 0.161
GREMLIN 0.183 0.145 0.106 0.193 0.162 0.121 0.215 0.206 0.160
EVfold 0.159 0.137 0.100 0.197 0.163 0.113 0.193 0.163 0.132