Skip to main content
. 2017 Apr 21;14:85. doi: 10.1186/s12985-017-0755-z

Table 1.

List of primer sequences use for first and second round PCR for each og the three HPV genotypes

HPV genotype First round PCR primers Second round PCR primers
HPV16 HPV16R1F (5’CACCTACTAATTGTGTTGTGG3’) HPV16R2F (5’GGGGTACCTCGGTTGCATGCTTTTTGGC3’)
HPV16R1R (5’GTTTGCACACACCCATG3’) HPV16R2R (5’GGTCTAGACGGTTTGCACACACCCATGT3’
HPV18 HPV18R1F (5’GTGTTTGTGGTATGGGTGTT3’) HPV18R2F (5’CGGTTGCATAAACTATGTAT3’)
HPV18R1R (5’GTATAGTATGTGCTGCCCAA3’) HPV18R2R (5’TCGGTTGCCTTTGGCTTATG3’),
HPV45 (fragment 1) HPV45F (5’GACCTCGTAAGCGTCCTGC3’) HPV45F (5’GACCTCGTAAGCGTCCTGC3’)
HPV45R (5’GGATGCTGTGTAGTATG CAAGTTTATA3’) HPV45R (5’GGATGCTGTGTAGTATG CAAGTTTATA3’);
HPV45 (fragment 2) HPV45F2 (5’GTATGGTGTTACTGTACATA ATTGTGG3’) HPV45F2 (5’GTATGGTGTTACTGTACATA ATTGTGG3’)
HPV45R2 (5’CATAGGGTGTGGATACAGTTGTG3’) HPV45R2 (5’CATAGGGTGTGGATACAGTTGTG3’)
HPV45 (fragment 3) HPV45F3 5’CTGGCACATTTACAACCCCTAC3’) HPV45F3 (5’CTGGCACATTTACAACCCCTAC3’)
HPV45R3 (5’CGCCATCCTGCAATGCAC 3’) HPV45R3 (5’CGCCATCCTGCAATGCAC 3’)