Table 3.
Reidentification by peak-analysis of SMG isolates that showed discrepancies in the species assignment by MALDI-TOF and the conventional or the molecular methods.
| Isolate number | Conventional methods/sequence analysis Id | Biotyper 6,903 MSPs | Score | Peak analysis (m/z) | ID by peak analysis | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4964.32 | 5297.61 | 5822.53 | 6839.07 | 6888.90 | 9516.46 | |||||
| 19 | S. oralis | S. mitis | 2.38 | − | + | + | + | − | − | S. oralis |
| 26 | S. oralis | S. mitis | 2.26 | − | − | + | + | − | − | S. oralis |
| 35 | S. oralis | S. mitis | 2.50 | − | + | + | + | − | − | S. oralis |
| 41 | S. mitis | S. oralis | 2.18 | − | − | − | + | − | − | S. mitis |
| 42 | S. mitis | S. oralis | 2.33 | − | − | − | + | − | − | S. mitis |
| 46 | S. mitis | S. oralis | 2.24 | − | − | − | + | − | − | S. mitis |
| 47 | S. mitis | S. oralis | 2.22 | − | − | + | + | − | − | S. oralis |
| 51 | S. mitis | S. oralis | 2.33 | − | + | + | + | − | − | S. oralis |
| 54 | S. oralis | S. mitis | 2.24 | − | + | + | + | − | − | S. oralis |
| 57 | S. oralis | S. mitis | 1.84 | − | + | + | + | − | − | S. oralis |
| 58 | S. oralis | S. mitis | 2.28 | − | + | + | + | − | − | S. oralis |
| 59 | S. oralis | S. mitis | 2.36 | − | − | + | + | − | − | S. oralis |
| 60 | S. oralis | S. mitis | 2.36 | − | − | + | − | − | − | S. oralis |
| 64 | S. oralis | S. mitis | 2.32 | − | + | + | + | − | − | S. oralis |
In all but two cases the identification provided by the reference methods was confirmed by peak analysis.