Skip to main content
. 2017 May 10;16:34. doi: 10.1186/s12941-017-0208-y

Table 2.

Sequence types (STs), allele profiles of 50 carbapenem-resistant A. baumannii isolates, carbapenem-hydrolyzing class D β-lactamase genes, minimum inhibitory concentration (MIC), site of isolation and patient outcome

Sample ID Site of isolation Allele profile ST Carbapenem-hydrolyzing class D β-lactamase genes MIC R ≥ 8 (mg/L) Patient outcome
gltA gyrB gdhB recA cpn60 gpi rpoD bla OXA-51 bla OXA-23 bla OXA-24 bla OXA-58 IMI
A. baumannii 21 ETA 1 3 3 2 2 96 3 195 + + 25 Deceased
A. baumannii 22 ETA 1 3 3 2 2 96 3 195 + + 20 Deceased
A. baumannii 30 ETA 1 3 3 2 2 97 3 208 + + 25 Deceased
A. baumannii 33 ETA 1 3 No gene 2 2 97 3 NA + + 25 Deceased
A. baumannii 34 ETA 1 3 3 2 2 97 3 208 + 35 Deceased
A. baumannii 36 ETA 1 3 3 2 2 97 3 208 + + 20 Deceased
A. baumannii 37 ETA 1 3 3 2 2 97 3 208 + + 30 Deceased
A. baumannii 44 Blood 1 3 3 2 2 97 3 208 + + 25 Deceased
A. baumannii 46 Urine 1 3 3 2 2 97 3 208 + + 25 Deceased
A. baumannii 47 Urine 1 3 No gene 2 2 97 3 NA + + 30 Discharged
A. baumannii 49 Urine 1 3 3 2 2 96 3 195 + + 25 Deceased
A. baumannii 5 ETA 1 12 3 2 2 79 3 1114 + + 20 Deceased
A. baumannii 29 ETA 1 87 3 2 2 96 3 13929a  + + 20 Discharged
A. baumannii 24 ETA 1 107 12 10 23 195 26 723 + + 25 Deceased
A. baumannii 25 ETA 1 107 12 10 23 195 26 723 + + 25 Deceased
A. baumannii 38 ETA 1 107 12 10 23 195 26 723 + + 30 Deceased
A. baumannii 48 urine 1 107 12 10 23 195 26 723 + + 25 Deceased
A. baumannii 1 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 30 Deceased
A. baumannii 3 ETA 10 12 4 11 4 79 5 945 + + 15 Deceased
A. baumannii 4 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 35 Discharged
A. baumannii 8 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 35 Deceased
A. baumannii 11 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 20 Deceased
A. baumannii 14 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 20 Deceased
A. baumannii 16 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 25 Discharged
A. baumanii 18 ETA 10 12 No gene 11 4 98 5 NA + + 20 Deceased
A. baumanii 19 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 20 Deceased
A. baumannii 20 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 20 Deceased
A. baumannii 23 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 15 Deceased
A. baumannii 26 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 25 Deceased
A. baumannii 27 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 20 Deceased
A. baumannii 28 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 20 Deceased
A. baumannii 31 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 25 Deceased
A. baumannii 32 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 20 Deceased
A. baumannii 35 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 25 Deceased
A. baumannii 40 ETA 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 25 Deceased
A. baumannii 41 Blood 10 12 4 11 4 100 5 441 + + 25 Discharged
A. baumannii 45 ETA 10 12 4 11 4 98 5 231 + + 20 Deceased
A. baumannii 12 ETA 12 17 12 1 29 102 39 236 + + 35 Deceased
A. baumannii 17 ETA 12 17 12 1 29 102 39 236 + + 35 Deceased
A. baumannii 2 ETA 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 20 Discharged
A. baumannii 6 ETA 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 25 Deceased
A. baumannii 7 ETA 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 20 Deceased
A. baumannii 13 ETA 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 15 Deceased
A. baumannii 15 ETA 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 15 Deceased
A. baumannii 39 ETA 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 35 Deceased
A. baumannii 42 Blood 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 25 Deceased
A. baumannii 50 Swab 24 92 96 11 49 162 26 499 + + 20 Deceased
A. baumannii 43 Blood 28 38 45 1 16 66 2 1089 + 25 Deceased
A. baumannii 9 ETA 44 73 No gene 11 44 4 NA + + 40 Deceased
A. baumannii 10 ETA 44 73 No gene 11 44 4 NA + + 20 Discharged

ETA endotracheal aspirate, + positive, − negative

a New sequence type (ST13929)

 gpi 173, 1 difference found. 33T → 33C