Skip to main content
. 2017 Feb 11;8(18):29540–29557. doi: 10.18632/oncotarget.15290

Table 3. Putative miR-204 gene targets selected according to the criteria described in the text.

GENE/miR204 GC GENE/miR204 TGCA GC GENE\miR204 TCGA CCA
GENE n° prediction tool R Pearson p value R Pearson p value R Pearson p value
RCC2 4 −0,9259432 4,8531E-09 −0,39189627 2,0096E-11 −0,37019042 0,01231233
STIL 4 −0,90967035 2,72938E-08 −0,44694006 1,14003E-14 −0,38264482 0,00948156
MKI67 4 −0,90660095 3,64488E-08 −0,36256828 6,35967E-10 −0,50656626 0,00038426
ARHGAP11A 5 −0,89475864 1,02086E-07 −0,40569912 3,49858E-12 −0,42570867 0,00355126
RAD51 5 −0,89072633 1,41036E-07 −0,31617519 7,6835E-08 −0,43233349 0,00301837
CDCA8 4 −0,88927317 1,57974E-07 −0,28193562 1,62836E-06 −0,49308009 0,00057882
SHCBP1 5 −0,88424802 2,31111E-07 −0,24936578 2,08907E-05 −0,47218798 0,00105717
KIF15 5 −0,88160634 2,80337E-07 −0,38587499 4,20188E-11 −0,42592368 0,00353275
FOXM1 4 −0,86068505 1,11981E-06 −0,28869853 9,18839E-07 −0,52210414 0,00023458
CENPE 5 −0,86029691 1,1465E-06 −0,36510107 4,78314E-10 −0,45798201 0,00155894
CENPA 5 −0,85914302 1,22917E-06 −0,29483137 5,39816E-07 −0,50666915 0,00038304
NOTCH1 6 −0,84324211 3,02813E-06 −0,28549794 1,20686E-06 −0,21394612 0,15818325
RACGAP1 4 −0,84295458 3,07508E-06 −0,3469437 3,49224E-09 −0,50154541 0,00044846
CCNF 5 −0,83267343 5,22975E-06 −0,30009111 3,38701E-07 −0,4391877 0,00254234
PDGFRB 5 −0,82538503 7,46221E-06 −0,21481712 0,000219939 −0,14263023 0,34996411
CDC25B 6 −0,81115812 1,42879E-05 −0,28939643 8,65415E-07 −0,39632472 0,00703537
SLC27A2 6 −0,80642962 1,75228E-05 −0,28327399 1,45574E-06 0,167963321 0,27007769
EPHB2 6 −0,8036086 1,97406E-05 −0,28920466 8,79792E-07 −0,26614462 0,07720508
FLVCR2 5 −0,80297101 2,02742E-05 −0,0582144 0,17304948 0,135952614 0,37320902
PAICS 4 −0,79451311 2,8629E-05 −0,32532083 3,17611E-08 0,038792834 0,80026628
MSR1 5 −0,78443992 4,23269E-05 −0,28314372 1,47174E-06 −0,02154619 0,88827667
PLXNA1 4 −0,78286517 4,49122E-05 −0,31782911 6,56325E-08 −0,32716505 0,02825738
CDH13 4 −0,78204978 4,63035E-05 −0,28911799 8,86364E-07 −0,26173396 0,08242663
CLDN1 5 −0,77870607 5,24052E-05 −0,34912016 2,76994E-09 −0,23370431 0,12232108
HSPH1 7 −0,770814 6,96208E-05 −0,26576022 6,02835E-06 −0,04712768 0,75852626
SCD 5 −0,76457661 8,64784E-05 −0,15310422 0,006377357 0,194194475 0,20116229
RTKN2 7 −0,76044893 9,94697E-05 −0,20430407 0,000420274 −0,3266414 0,0285259
LOXL2 5 −0,75798142 0,00010801 −0,19661312 0,000661776 −0,38198982 0,00961508
CACYBP 5 −0,75630081 0,000114181 −0,39534122 1,30887E-11 −0,39391464 0,00742171
MMP3 5 −0,75226712 0,000130239 −0,16531766 0,003552365 NA NA
KIAA1199 4 −0,74112207 0,000185051 −0,17897512 0,001762564 −0,23281225 0,12379495
F2R 5 −0,73972529 0,000193143 −0,19232703 0,000846249 −0,07661501 0,61691822
INHBA 7 −0,73433465 0,000227276 −0,27265961 3,48467E-06 −0,18796101 0,21628935
MANEAL 4 −0,7321102 0,000242795 −0,23681267 5,11871E-05 0,036703909 0,81081924
PKM2 4 −0,72843075 0,000270451 −0,21819256 0,000177462 −0,45360692 0,00175125
TFAP2A 4 −0,71306986 0,000416889 −0,24246373 3,43952E-05 −0,48946511 0,00064417
FAP 7 −0,71170461 0,000432668 −0,20515966 0,000399165 −0,2879022 0,0551385

For each gene are reported the number of the microRNA target prediction tools used for the analysis, and the Pearson anti-Correlation value and the p-value calculated for our discovery set, for the gastric TGCA dataset, and the cholangiocarcinoma TGCA dataset, respectively.