Skip to main content
. 2017 May 29;7(2):95. doi: 10.1007/s13205-017-0738-1

Table 1.

Comparative 16S rDNA and PQQ gene abundance in different sampling sites as revealed by qPCR analysis. Each value is the mean of three replicates. Values in parentheses indicate standard error

S. no. Sampling site Latitude, longitude Elevation (m) Climate Copy No. (per g of soil)
16SrDNA gene PQQ gene
1 Surkhanda 30°24′41″N, 78°17′17″E 2757 Temperate 1.19 × 1010 (±1.11 × 102) 1.12 × 102 (±1.08 × 102)
2 Munsyari 30.07°N, 80.23°E 2200 Temperate 1.59 × 1012 (±1.36 × 103) 1.38 × 103 (±2.98 × 102)
3 Chakrata 30°41′46″N, 77°52′10″E 2118 Temperate 1.50 × 1010 (±1.37 × 103) 3.11 × 102 (±1.21 × 102)
4 Nainital 29.23°N, 79.30°E 2084 Temperate 2.69 × 1011 (±2.31 × 103) 1.62 × 103 (±1.90 × 102)
5 Mussoorie 30°27′15″N, 78°5′0″E 2005.5 Temperate 1.47 × 109 (±2.21 × 102) 2.35 × 102 (±1.01 × 102)
6 Pauri 30°8′54″N, 78°46′26″E 1814 Sub-temperate 3.57 × 108 (±3.01 × 102) 5.38 × 102 (±2.92 × 102)
7 Lansdowne 29°50′35″N, 78°40′44″E 1700 Sub-temperate 1.10 × 1010 (±1.14 × 102) 4.38 × 102 (±1.09 × 102)
8 Mahabgarh 29°52′40″N, 78°27′18″E 1650 Sub-temperate 2.96 × 1010 (±1.91 × 102) 1.09 × 103 (±1.11 × 102)
9 Chamba 30°21′59″N, 78°23′49″E 1524 Sub-temperate 1.27 × 109 (±2.01 × 103) 2.89 × 102 (±1.78 × 102)
10 Kandakhal 29.52°N, 78.34°E 1427 Subtropical 4.63 × 1010 (±1.12 × 102) 3.11 × 103 (±1.4 × 102)
11 Dugadda 29°48′28″N, 78°36′30″E 932 Subtropical 7.40 × 109 (±1.48 × 102) 5.99 × 102 (±1.63 × 102)
12 Aamsour 29°47′10″N, 78°35′13″E 745 Subtropical 2.80 × 1010 (±3.01 × 102) 1.90 × 102 (±1.33 × 102)
13 Satpuli 29°55′10″N, 78°42′33″E 657 Subtropical 7.17 × 109 (±1.91 × 102) 3.38 × 102 (±2.61 × 102)
14 Srinagar 30°13′31″N, 78°47′42″E 560 Subtropical 1.03 × 1010 (±1.44 × 103) 4.36 × 102 (±1.95 × 102)
15 Kotdwar 29°45′24″N, 78°29′17″E 454 Subtropical 1.80 × 1010 (±2.66 × 103) 1.01 × 103 (±1.93 × 102)