Skip to main content
. 2017 May 30;17:121. doi: 10.1186/s12862-017-0966-3

Table 3.

Geographical distances (GEO) and genetic differentiation (F ST) between population samples. First listed matrix is below the diagonal and second matrix is above

Matrix 11°N 9°N GAR 7°S 11°S 17°S 23°S 32°S 38°S
16S/GEO 11°N 208 1404 2035 2578 3341 4010 4772 5507
9°N - 1243 2035 2578 3197 3815 4564 5261
GAR - - 4773 2337 3039 3660 4240 4787
7°S - 0.110 - 2387 1232 1947 2691 3379
11°S - <0.001 - 0.114 744 1455 2233 2944
17°S - <0.001* - 0.094 <0.001* 701 1553 2272
23°S - 0.001* - 0.061 0.002* <0.001* 957 1662
32°S - 0.003 - 0.132 0.001 0.003 0.005 722
38°S - <0.001 * - 0.069 0.002 <0.001 * 0.001 * 0.005
COI/dnaK 11°N 0.04 0.25 0.28 0.27 0.36 0.46 0.92 0.92
9°N 0.03 0.10 0.15 0.15 0.20 0.25 0.89 0.89
GAR 0.02 0.02 0.06 0.06 0.08 0.11 0.91 0.91
7°S 0.31 0.36 0.34 0.07 0.07 0.14 0.89 0.89
11°S 0.03 0.06 0.08 0.34 0.04 0.09 0.90 0.90
17°S 0.10 0.12 0.11 0.12 0.12 0.03 0.90 0.90
23°S 0.15 0.24 0.19 0.2 0.16 0.1 0.92 0.92
32°S 0.88 0.90 0.90 0.89 0.91 0.88 0.88 0.15
38°S 0.87 0.90 0.88 0.88 0.90 0.86 0.85 0.08
pgi/pykF 11°N 0.17 0.12 0.15 0.10 0.19 0.12 0.69 0.78
9°N 0.09 0.10 0.14 0.06 0.20 0.17 0.64 0.70
GAR 0.16 0.04 0.09 0.08 0.09 0.08 0.65 0.72
7°S 0.24 0.13 0.09 0.08 0.05 0.04 0.58 0.66
11°S 0.25 0.11 0.08 0.02 0.14 0.09 0.61 0.67
17°S 0.15 0.10 0.09 0.04 0.04 0.02 0.63 0.73
23°S 0.23 0.15 0.13 0.07 0.05 0.06 0.61 0.72
32°S 0.78 0.78 0.77 0.78 0.78 0.78 0.78 0.13
38°S 0.83 0.82 0.81 0.84 0.85 0.82 0.85 0.05
rpoD/soxA 11°N 0.27 0.30 0.26 0.23 0.21 0.18 0.92 0.91
9°N 0.12 0.08 0.08 0.31 0.28 0.26 0.88 0.87
GAR 0.10 0.14 0.04 0.39 0.33 0.33 0.87 0.87
7°S 0.25 0.22 0.26 0.31 0.26 0.25 0.91 0.89
11°S 0.09 0.07 0.09 0.18 0.24 0.01 1.00 0.98
17°S 0.31 0.21 0.20 0.27 0.12 0.17 0.96 0.94
23°S 0.24 0.15 0.25 0.24 0.11 0.15 0.99 0.97
32°S 0.81 0.82 0.83 0.81 0.81 0.85 0.81 0.07
38°S 0.76 0.78 0.78 0.76 0.77 0.82 0.74 0.04

Note: Geographic distances in km

All F ST estimates of protein-coding genes are significant after Bonferroni correction, but some (*) of the 16S encoding gene are not significant after Bonferroni correction. Italicized F ST represent comparisons between populations belonging to two geographical groups, EPR + GAR and PAR. Bold italicized F ST estimates indicate highly genetic differentiation of functional genes between two populations, 23and 32°S, that are isolated from each other with the Easter Microplate intervening