Table 6.

Scoring Functions Enrichment Performance for DUD-E Kinases

Symbol	Glide						Vina
	SVMGen			GlideScore			SVMGen			GlideScore
	Crystal	High	Low	Crystal	High	Low	Crystal	High	Low	Crystal	High	Low
AKT1	0.84	0.86	0.81	0.65	0.68	0.60	0.84	0.85	0.80	0.70	0.79	0.71
AKT2	0.79	0.79	0.82	0.63	0.64	0.63	0.79	0.79	0.82	0.72	0.66	0.64
PRKCB	0.78	0.77	0.71	0.68	0.64	0.61	0.78	0.76	0.71	0.68	0.65	0.50
ROCK1	0.69	0.70	0.61	0.70	0.66	0.69	0.69	0.70	0.61	0.74	0.80	0.71
MAPKAPK2	0.61	0.59	0.45	0.78	0.78	0.51	0.62	0.59	0.45	0.75	0.77	0.63
CDK2	0.73	0.61	0.58	0.75	0.55	0.55	0.73	0.61	0.57	0.78	0.61	0.61
MAPK1	0.52	0.47	0.43	0.77	0.63	0.55	0.53	0.47	0.41	0.73	0.70	0.68
MAPK10	0.79	0.69	0.72	0.72	0.69	0.42	0.79	0.69	0.72	0.68	0.63	0.62
MAPK14	0.80	0.71	0.76	0.59	0.58	0.65	0.80	0.70	0.76	0.66	0.55	0.58
MAP2K1	0.43	0.61	0.65	0.69	0.53	0.55	0.42	0.62	0.64	0.67	0.61	0.56
BRAF	0.88	0.87	0.65	0.78	0.67	0.69	0.88	0.87	0.65	0.81	0.72	0.56
TGFBR1	0.92	0.88	0.91	0.73	0.73	0.51	0.92	0.88	0.91	0.86	0.82	0.51
ABL1	0.84	0.85	0.82	0.63	0.64	0.62	0.83	0.84	0.82	0.76	0.74	0.72
CSF1R	0.71	0.62	0.68	0.53	0.56	0.65	0.70	0.61	0.68	0.66	0.60	0.54
EGFR	0.80	0.75	0.86	0.68	0.56	0.58	0.80	0.75	0.86	0.57	0.61	0.72
PTK2	0.95	0.93	0.87	0.64	0.49	0.62	0.95	0.94	0.86	0.83	0.52	0.70
FGFR1	0.83	0.77	0.75	0.61	0.62	0.63	0.83	0.77	0.76	0.67	0.67	0.64
SRC	0.88	0.85	0.86	0.60	0.59	0.57	0.88	0.85	0.86	0.75	0.59	0.59
KDR	0.81	0.57	0.69	0.62	0.57	0.59	0.82	0.54	0.69	0.68	0.60	0.56
IGF1R	0.74	0.69	0.72	0.64	0.54	0.53	0.75	0.69	0.73	0.74	0.62	0.62
JAK2	0.86	0.86	0.85	0.78	0.72	0.72	0.86	0.86	0.86	0.77	0.71	0.64
KIT	0.76	0.80	0.74	0.59	0.58	0.56	0.75	0.80	0.73	0.63	0.49	0.58
LCK	0.82	0.80	0.76	0.75	0.67	0.57	0.81	0.79	0.76	0.75	0.59	0.59
MET	0.92	0.59	0.49	0.66	0.55	0.77	0.92	0.58	0.48	0.87	0.57	0.54
PLK1	0.54	0.53	0.53	0.78	0.66	0.67	0.55	0.54	0.53	0.77	0.68	0.67
WEE1	0.76	0.59	0.47	0.54	0.53	0.48	0.75	0.60	0.44	0.70	0.49	0.57
Mean	0.77	0.72	0.70	0.67	0.62	0.60	0.77	0.72	0.70	0.73	0.65	0.62
95% CI	0.05	0.05	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.06	0.03	0.04	0.03