Table 6.
1 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 24 | 27 | 28 | 30 | 37 | 41 | 44 | 51 | 62 | 63 | 64 | 74 | 90 | 92 | |
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T. tomaculum | G | G | T | G | C | T | C | G | T | T | T | A | G | C | C | G | T | - | - | T | C | G | - | T | T |
T. sphagneti | T | . | C | T | G | A | T | C | . | C | C | C | T | . | . | . | C | T | C | C | . | T | - | A | . |
C. prima | T | . | C | T | G | A | T | T | . | C | . | T | T | . | . | . | C | T | T | . | . | T | - | A | . |
T. secunda | . | . | C | A/. | . | . | . | . | A | . | C | C | . | . | . | A | . | - | - | . | T | . | - | . | . |
T. warcupii | . | A | C | . | . | C | . | C | . | . | . | . | . | ./T | T | . | . | - | - | . | . | . | C | . | C |
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97 | 99 | 105 | 107 | 111 | 113 | 117 | 120 | 121 | 122 | 123 | 124 | 125 | 126 | 129 | 131 | 135 | 136 | 144 | 145 | 146 | 147 | 149 | 150 | 152 | |
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T. tomaculum | C | A | C | T | C | G | C | G | G | C | - | T | G | G | C | A | A | G | C | C | G | - | T | C | T |
T. sphagneti | T | C | . | . | . | A | T | . | - | T | C | C | . | A | . | T | T | . | T | . | . | G | . | . | C |
T. prima | T | . | C | C | . | A | T | T | . | T | - | C | . | ./A | . | T | T | T | T | . | . | G | C | A | . |
T. secunda | . | . | . | . | . | . | . | A | . | A | - | . | T | . | T/. | . | . | . | . | T | T | G | C | T | C |
T. warcupii | . | . | . | . | T | . | . | . | T | T | - | . | . | . | . | . | . | . | . | . | T | - | . | . | C |
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153 | 155 | 160 | 162 | 163 | 172 | 174 | 180 | 182 | 183 | 184 | 195 | 196 | 197 | 209 | 212 | 214 | 215 | 218 | 231 | 232 | 233 | 234 | 259 | 376 | |
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T. tomaculum | G | A | T | C | T | G | C | T | A | A | C | C | T | T | T | - | A | - | T | C | A | T | A | T | T |
T. sphagneti | A | G | C | . | C | A | . | . | T | . | T | T | C | C | . | A | T | T | C | . | . | . | . | . | C |
T. prima | . | G | C | . | ./C | A/T | . | . | C | . | T | T | C | . | ./C | A | T | T | C | A | . | . | . | C | C |
T. secunda | . | . | C | T | C | A | T | . | C | . | . | A | . | . | . | A | - | - | C | . | . | C | . | . | . |
T. warcupii | . | . | C | . | C | T | . | C | . | G | . | T | . | A | C | A | . | T | . | . | G | . | T | . | . |
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378 | 391 | 410 | 411 | 414 | 421 | 422 | 423 | 424 | 425 | 426 | 431 | 432 | 434 | 435 | 436 | 438 | 445 | 447 | 448 | 449 | 452 | 454 | 455 | 456 | |
| |||||||||||||||||||||||||
T. tomaculum | T | C | T | C | C | C | C | T | G | A | T | C | T | G | G | C | G | C | G | T | G | C | C | T | C |
T. sphagneti | C | T | . | . | A | . | . | C | T | C | . | T | C | A/. | . | . | . | . | . | . | . | . | T | C | T |
T. prima | C | T | . | . | A | . | . | C | A/T | T/C | . | T | C | A/. | . | T | . | . | . | C | A/. | T | T | C | T |
T. secunda | . | . | . | . | . | T | . | . | . | T | . | T | . | A | A | T | . | . | A | . | . | . | T | C | . |
T. warcupii | . | . | C | G | . | . | T | . | A | . | A | . | . | . | . | . | A | T | . | C | . | . | T | C | . |
| |||||||||||||||||||||||||
457 | 458 | 459 | 460 | 463 | 469 | 470 | 471 | 472 | 475 | 481 | 482 | 484 | 486 | 490 | 492 | 493 | 494 | 497 | 501 | 503 | 504 | 505 | 506 | 508 | |
| |||||||||||||||||||||||||
T. tomaculum | G | C | G | T | T | A | C | C | A | T | - | - | - | G | T | G | C | A | G | C | C | G | T | T | G |
T. sphagneti | . | . | A | . | C | G | . | . | G | . | C | A | - | C | C | . | . | G | . | T | T | . | G | . | . |
T. prima | . | T | . | . | . | G | . | T | G | C | A | T | - | . | C | . | T | G | T | T | . | A | A | A | ./A |
T. secunda | A | . | A | C | . | G | . | . | G/. | C | C | T | C/T | . | . | . | ./T | G | . | T | T | . | . | . | A |
T. warcupii | . | T | . | C | C | G | T | . | G | - | C | T | - | . | C | A | . | G | . | . | . | . | . | . | A |
| |||||||||||||||||||||||||
509 | 510 | 511 | 513 | 514 | 515 | 516 | 517 | 518 | 519 | 521 | 522 | 523 | 525 | 526 | 527 | 532 | 540 | 542 | 545 | 548 | 549 | 550 | 551 | 553 | |
| |||||||||||||||||||||||||
T. tomaculum | C | G | G | A | G | A | T | G | T | G | T | A | - | G | T | T | T | C | G | C | C | A | T | C | C |
T. sphagneti | . | . | T | G | C | T | C | C | A | T | A | G | T | . | C | . | C | . | T | T | . | G | G | T | . |
T. prima | . | A | ./T | G | T | T | C | T | G/A | C | . | G | T | . | C | . | C | . | T | T | . | G | A | T/. | . |
T. secunda | . | . | . | . | A | . | C | C | . | T | . | G | - | A | C | . | . | T | . | . | A | G | A | - | . |
T. warcupii | T | . | . | G | . | G | C | T | . | T | . | G | - | . | C | G | C | . | . | T | . | G | A | . | A |
| |||||||||||||||||||||||||
554 | 555 | 557 | 558 | 562 | 565 | 566 | 571 | 577 | 587 | 588 | 590 | 592 | 594 | 595 | 598 | 599 | 600 | 606 | 607 | 623 | 644 | 645 | 646 | 647 | |
| |||||||||||||||||||||||||
T. tomaculum | C | C | - | - | G | T | G | C | C | C | - | T | C | T | G | A | G | A | T | T | T | C | T | C | T |
T. sphagneti | T | A | C | C | A | A | . | . | . | . | G | C | T | G | T | G | C | G | . | . | G | . | C | . | . |
T. prima | T | A | - | C | A | G | . | T | ./T | . | G | C | T | G | T | . | T | . | . | . | G | . | C | T | G |
T. secunda | T | T | C | C | - | C | A | . | . | T | G | . | . | . | . | . | . | . | . | ./C | G | . | C | T | G |
T. warcupii | T | . | - | C | A | C | . | . | . | . | G | . | - | C | . | . | . | . | C | C | . | T | C | . | . |
| |||||||||||||||||||||||||
657 | 658 | 659 | 660 | 662 | 663 | 664 | 665 | 667 | 668 | 669 | 670 | 671 | 675 | 680 | 681 | 686 | 687 | 688 | 689 | 690 | 695 | 696 | 698 | 700 | |
| |||||||||||||||||||||||||
T. tomaculum | T | C | G | G | T | C | - | G | G | T | G | C | C | G | C | T | C | T | C | G | - | G | A | C | T |
T. sphagneti | . | G | . | A | . | . | - | T | . | A | C | . | T | A | . | . | . | . | . | . | - | A | . | A | - |
T. prima | . | G | . | A | . | . | - | T | . | A | . | . | T | . | . | . | . | . | . | . | - | A | C | A | - |
T. secunda | C | T | . | A | . | . | T | T | . | C | . | . | . | . | A | C | T | . | . | . | - | A | . | T | G |
T. warcupii | G | A | T | . | C | G | - | A | A | C | . | T | . | . | . | C | T | C | T | A | C | A | . | . | - |
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703 | 707 | 708 | 709 | 710 | 711 | 712 | 713 | 714 | 717 | 719 | 720 | 721 | 723 | 724 | 725 | 726 | 727 | 728 | 746 | 749 | 750 | 756 | |||
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T. tomaculum | - | G | C | T | G | T | G | C | - | - | A | - | A | - | C | - | T | C | A | T | G | T | G | ||
T. sphagneti | T | T | T | C | C | . | C | G | - | T | G | G | G | - | - | T | . | . | . | C | A | . | T | ||
T. prima | T | T | T | C | A | . | T | G | - | C | G | - | - | - | T | T | . | . | . | C | A | C | T | ||
T. secunda | A | T | T | - | T | G | T | - | - | T | G | - | . | G | . | T | C | . | . | . | . | . | . | ||
T. warcupii | - | T | T | C | - | G | T | G | C | G/- | G | - | . | - | . | - | C | . | T | . | . | . | . |