TABLE 1.

Bacteriocin gene clusters identified in bovine non-aureus staphylococcal genomes and inhibitory phenotypes tested against S. aureus and MRSA

Species (n)	No. of isolatesa	Group ID	In vitro inhibition (n)		No. of bacteriocin gene clusters
			S. aureus	MRSAb	Class I			Class II				Total
					Lanthipeptide	Sactipeptide	Lasso peptide	a	b	c	d
S. agnetis (13)	13	SAG	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. arlettae (15)	15	SAR	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. auricularis (2)	2	SAU	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. capitis (22)	5	SCAP1	−	NT	1	0	0	0	0	0	0	1
	5	SCAP2	+	+	1	0	0	0	0	0	0	1
	1	SCAP3	−	NT	1	1	0	0	0	0	0	2
	1	SCAP4	+	+	0	1	0	0	0	0	0	1
	1	SCAP4	+	−	1	1	0	0	0	0	0	2
	7	SCAP5	+ (7)	+ (5)	0	0	0	0	0	0	0	0
	2	SCAP6	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. caprae (1)	1	SCAR	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. chromogenes (82)	2	SCH1	+	+	1	0	0	0	0	0	0	1
	1	SCH2	+	+	0	0	0	0	0	0	0	0
	79	SCH3	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. cohnii (24)	2	SCO1	−	NT	1	0	0	0	0	0	0	1
	22	SCO2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. devriesei (8)	8	SDE	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. epidermidis (26)	2*	SEP1	+	+	1	0	0	0	0	0	0	1
	24	SEP2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. equorum (17)	2	SEQ1	−	NT	0	0	0	0	0	0	1	1
	3	SEQ2	−	NT	0	0	0	1	0	0	0	1
	1	SEQ3	−	NT	1	0	0	0	0	0	0	1
	11	SEQ4	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. fleurettii (2)	2	SFL1	−	NT	0	0	1	0	0	0	0	1
S. gallinarum (21)	14	SGA1	−	NT	0	0	0	0	0	1	0	1
	2	SGA2	−	NT	1	0	0	0	0	1	0	2
	5	SGA3	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. haemolyticus (29)	1	SHA1	−	NT	0	0	0	0	0	1	0	1
	28	SHA2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. hominis (11)	11	SHO	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. hyicus (3)	1	SHY1	−	NT	0	0	0	0	0	0	1	1
	2	SHY2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. kloosii (1)	1	SKL	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. nepalensis (2)	2	SNE	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. pasteuri (6)	1	SPA1	+	+	0	0	0	0	0	0	0	0
	5	SPA2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. saprophyticus (16)	1	SSA1	−	NT	0	0	0	1	0	0	0	1
	1	SSA2	+	−	0	0	0	0	0	0	0	0
	14	SSA2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. sciuri (30)	3	SSC1	−	NT	0	0	0	0	0	0	1	1
	1	SSC2	+	−	1	0	0	0	0	0	0	1
	1	SSC3	+	−	0	0	0	0	0	0	1	1
	1	SSC4	+	−	0	0	1	0	0	0	0	1
	1	SSC4	−	NT	0	0	1	0	0	0	0	1
	6	SSC5	+ (6)	−	0	0	0	0	0	0	0	0
	17	SSC6	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. simulans (42)	19	SSI1	−	NT	0	0	0	0	0	0	1	1
	1	SSI2	−	NT	1	0	0	0	0	0	1	2
	1*	SSI3	+	−	1	0	0	0	0	0	1	2
	1*	SSI4	+	−	0	0	0	0	0	1	1	2
	3	SSI5	+	+	1	0	0	0	0	0	1	2
	2	SSI6	+	+	0	0	0	0	0	0	1	1
	1	SSI7	+	−	0	0	0	0	0	0	0	0
	14	SSI8	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. succinus (15)	1	SSU1	−	NT	1	0	0	0	0	0	0	1
	14	SSU2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. vitulinus (6)	1	SVI1	−	NT	1	0	0	0	0	0	0	1
	5	SVI2	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. warneri (19)	5	SWA1	−	NT	0	0	0	0	0	0	1	1
	1	SWA2	+	−	0	0	0	0	0	0	0	0
	13	SWA3	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0
S. xylosus (28)	8	SXY1	−	NT	0	0	0	0	0	0	1	1
	1*	SXY2	+	+	0	0	0	0	0	1	0	1
	19	SXY3	−	NT	0	0	0	0	0	0	0	0

^aAn asterisk indicates inhibitory activity was achieved with the chloroform-extracted product and inhibition was suppressed with the addition of proteinase K.

^bNT, not tested.