Table 1. List of the genes and the fold changes in the expression of genes encoding cytostatic-drug resistance-related proteins in the drug-resistant sublines. NS: up/down regulated expression of between 5 and -5-fold, or insignificant alterations.
Gene Symbol | NCBI RefSeq ID | Fold change | |||||||||||
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C vs. P1 | C vs. P2 | W1 vs. PR | C vs. C1 | C vs. C2 | W1 vs. CR | C vs. D1 | C vs. D2 | W1 vs. DR | C vs. T1 | C vs. T2 | W1 vs. TR | ||
ABCB1 | NM_000927 | 84,68 | 236,94 | 227,11 | N.S | N.S | N.S | 74,03 | 118,92 | 78,12 | N.S | N.S | N.S |
ABCB4 | NM_000443 | 116,76 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | 18,03 | 6,92 | 176,03 | N.S | N.S | N.S |
ABCC6 | NM_001079528 | N.S | N.S | N.S | -8,51 | -7,08 | -7,19 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S |
ABCG2 | NM_001257386 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | 204,17 | 167,94 | 258,73 |
BST2 | NM_004335 | N.S | N.S | N.S | -54,66 | -12,69 | -5,19 | N.S | -21,27 | N.S | N.S | N.S | 13,57 |
EPHA7 | NM_004440 | 8,14 | 14,58 | 8,13 | N.S | N.S | N.S | N.S | 5,53 | N.S | N.S | N.S | 5,37 |
ERAP2 | NM_001130140 | N.S | N.S | N.S | -5,98 | -5,29 | -10,83 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S |
HERC5 | NM_016323 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | 9,84 | 14,00 | 35,94 |
IFI16 | NM_001206567 | 405,21 | N.S | -6,47 | N.S | N.S | -6,10 | 207,14 | 13,30 | 6,45 | N.S | N.S | N.S |
IFIH1 | NM_022168 | 6,12 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | 47,03 | N.S | N.S | 6,93 | 6,79 | 14,32 |
LIPG | NM_006033 | -5,63 | -10,46 | -11,51 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | -9,18 |
MCTP1 | NM_001002796 | -19,18 | -20,95 | -23,26 | -20,44 | -13,56 | -14,79 | N.S | -19,29 | N.S | -19,15 | -21,37 | -8,21 |
MYOT | NM_001135940 | 9,53 | N.S | 7,39 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | 9,19 | 7,82 | 16,47 |
NSBP1 | AF250329 | -6,27 | -5,10 | -10,34 | N.S | N.S | -13,92 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | -9,51 |
PCDH9 | NM_020403 | -6,34 | -38,72 | -5,31 | 12,73 | N.S | N.S | 7,74 | -25,66 | -8,99 | N.S | N.S | N.S |
PTPRK | NM_001135648 | -15,10 | -59,18 | -38,18 | -38,67 | -96,85 | N.S | N.S | N.S | N.S | -5,36 | -7,07 | -16,81 |
RUNDC3B | NM_001134405 | 13,07 | 56,57 | 10,26 | N.S | N.S | N.S | 8,56 | N.S | 17,55 | N.S | N.S | N.S |
S100A3 | NM_002960 | N.S | N.S | N.S | 6,27 | 11,13 | N.S | N.S | N.S | N.S | 17,63 | 43,38 | 6,53 |
SAMD4A | NM_001161576 | 6,11 | 6,79 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | 6,79 | 10,00 | 5,51 |
SEMA3A | NM_006080 | -10,55 | -21,08 | -60,31 | N.S | N.S | N.S | 5,87 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S |
SPP1 | NM_000582 | 19,42 | N.S | N.S | N.S | 54,95 | N.S | 13,75 | 13,06 | N.S | 213,44 | 229,77 | 279,28 |
TGFBI | NM_000660 | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | N.S | 27,95 | 17,48 | 11,10 |