Table 2.
Drug resistance profile according to lineages found in Chad
| Clade/Lineage | MDR | RMP mono | INH mono | Pan susceptible | Total | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| N | (%) | N | % | N | % | N | % | N | |
| Afri-2 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 2 | (100) | 2 |
| Cameroon | 8 | (6) | 8 | (6) | 17 | (13) | 97 | (75) | 130 |
| CAS1 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 18 | (100) | 18 |
| EAI3-IND | 0 | (0) | 1 | 50 | 0 | (0) | 1 | (50) | 2 |
| H1 | 1 | (1) | 4 | (7) | 8 | (13) | 48 | (79) | 61 |
| H3 | 0 | (0) | 1 | (6) | 0 | (0) | 16 | (94) | 17 |
| LAM11 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 1 | (100) | 1 |
| Manu1 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 1 | (100) | 1 |
| Manu2 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 2 | (100) | 2 |
| S | 0 | (0) | 0 | (0) | 1 | (50) | 1 | (50) | 2 |
| T | 0 | (0) | 0 | (0) | 2 | (67) | 1 | (33) | 3 |
| T1 | 3 | (13) | 2 | (8) | 7 | (29) | 12 | (50) | 24 |
| T1-RUS2 | 0 | (0) | 0 | (0) | 1 | (11) | 8 | (19) | 9 |
| T2 | 1 | (5) | 1 | (5) | 2 | (10) | 17 | (80) | 21 |
| T3 | 1 | (100) | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 1 |
| T5 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 2 | (100) | 2 |
| T5-RUS2 | 0 | (0) | 0 | (0) | 0 | (0) | 5 | (100) | 5 |
| X1 | 0 | (0) | 0 | (0) | 1 | (33) | 2 | (67) | 3 |
| X2 | 0 | (0) | 0 | (0) | 3 | (43) | 4 | (57) | 7 |
| Total | 14 | (4.5) | 17 | (5.4) | 42 | (13.5) | 238 | (76.6) | 311 |