Table 2.

Summary of SNP markers analyzed and average linkage disequilibrium (LD; r ²) between synthetic adjacent markers obtained for each autosome (OAR)

OAR	n	Mean LD	SDa LD	Mean Distance, Mb	SDa Distance, Mb
1	707	0.09	0.17	0.75	1.5
2	683	0.09	0.15	1.01	1.9
3	222	0.04	0.04	2.60	3.0
4	297	0.05	0.09	2.64	3.1
5	369	0.10	0.19	0.72	1.5
6	112	0.03	0.10	2.7	2.5
7	79	0.02	0.04	3.4	2.8
8	288	0.06	0.13	1.9	2.8
9	313	0.07	0.14	1.3	2.3
10	108	0.04	0.10	3.7	2.8
11	171	0.06	0.11	1.5	2.5
12	224	0.06	0.12	1.9	2.7
13	228	0.07	0.14	2.1	2.6
14	131	0.07	0.14	3.0	3.1
15	253	0.08	0.16	1.5	2.5
16	257	0.08	0.16	1.7	2.4
17	152	0.07	0.16	2.6	3.1
18	190	0.07	0.12	1.7	2.5
19	87	0.03	0.09	2.6	2.9
20	137	0.03	0.10	3.4	2.9
21	168	0.06	0.16	2.1	2.8
22	137	0.03	0.06	2.2	2.7
23	201	0.08	0.12	0.9	1.7
24	125	0.09	0.17	1.6	2.1
25	84	0.02	0.11	3.2	2.6
26	175	0.07	0.13	0.93	1.7

^aSD: Standard deviation