Skip to main content
. 2017 Sep 8;12(9):e0184464. doi: 10.1371/journal.pone.0184464

Table 3. Main structural features of the four sequenced mt genomes in this study.

Donax semistriatus Donax trunculus Donax variegatus Donax vittatus
Total length 17044 17365 17195 17070
A+T% 61.9 58.9 60.4 63.5
cox2 846 (ATG/TAA) 846 (ATG/TAA) 831 (ATG/TAG) 846 (ATG/TAA)
tRNA-Val 62 64 64 64
tRNA-Trp 69 68 69 69
tRNA-Gly 64 65 66 66
rrnS 863 860 859 865
tRNA-Met 65 65 65 65
atp8 126 (ATG/TAG) 126 (ATG/TAG) 126 (ATG/TAA) 126 (ATG/TAG)
tRNA-Ser1 68 69 69 68
nad6 576 (ATG/TAG) 573 (ATG/TAA) 540 (ATG/TAA) 576 (ATG/TAG)
rrnL 1373 1367 1383 1386
atp6 714 (ATG/TAA) 714 (ATG/TAA) 711 (ATG/TAG) 714 (ATG/TAG)
cox3 891 (ATG/TAG) 915 (ATA/TAA) 891 (ATG/TAG) 891 (ATG/TAG)
nad2 1062 (ATG/TAA) 1062 (TTG/TAG) 1062 (ATG/TAA) 1062 (ATG/TAA)
tRNA-Pro 67 68 67 67
tRNA-Gln 65 66 67 65
tRNA-Cys 66 66 68 66
tRNA-Ala 64 65 66 65
tRNA-Phe 63 64 64 63
cox1 1710 (ATG/TAA) 1710 (ATG/TAA) 1710 (ATG/TAA) 1710 (ATG/TAA)
nad4 1347 (TTG/TAA) 1356 (TTG/TAG) 1332 (TTG/TAA) 1347 (TTG/TAA)
tRNA-His 66 66 66 64
tRNA-Ser2 66 65 66 65
tRNA-Glu 63 64 63 63
nad3 363 (ATG/TAA) 363 (ATG/TAA) 363 (ATG/TAA) 363 (ATG/TAA)
tRNA-Ile 69 69 69 69
tRNA-Lys 65 63 64 64
nad4l 288 (TTG/TAG) 288 (TTG/TAG) 288 (ATG/TAA) 288 (TTG/TAG)
tRNA-Tyr 64 64 66 65
tRNA-Thr 63 65 66 64
tRNA-Leu1 65 66 65 65
tRNA-Asp 63 62 64 63
tRNA-Leu2 65 66 65 66
nad1 924 (ATG/TAG) 924 (ATG/TAA) 924 (ATG/TAG) 924 (ATG/TAG)
tRNA-Asn 65 64 66 65
nad5 1734 (ATG/TAA) 1734 (GTG/TAG) 1734 (ATG/TAA) 1734 (ATG/TAA)
tRNA-Arg 63 63 63 63
cob 1215 (ATG/TAA) 1218 (ATA/TAA) 1206 (ATG/TAA) 1215 (ATG/TAA)

For each mt genome, total length (in bp), the percent of overall A+T content, and size (bp) of the protein coding genes (start and stop codons in brackets), tRNAs, rrnL and rrnS are given.