Table 1.
Gene | PCR Primer sequence | Annealing T. (°C) | PCR product (bp) | Sequencing Primer | CpG sites |
---|---|---|---|---|---|
AluYb8 | F: 5′-AGATTATTTTGGTTAATAAG-3′ R (Bt): 5′-AACTACRAACTACAATAAC-3′ |
49 | 178 | 1: 5′-GTTTGTAGTTTTAGTTATT-3′ | 5 |
LINE1 | F (Bt): 5′-TAGGGAGTGTTAGATAGTGG-3′ R: 5′-AACTCCCTAACCCCTTAC-3′ |
58 | 109 | 1: 5′-CAAATAAAACAATACCTC-3′ | 7 |
OGG1 | F: 5′-GTGGTTTTGAAGAYGGATAGT-3′ R (Bt): 5′-CTCCAAAAACAAACCACAAC-3′ |
58 | 267 | 1: 5′-AGTTTTGAGGAAT-3′ 2: 5′-GAGAGTTTAGTGT-3′ |
7 8 |
SEPP1 | F: 5′-GAAATTGTGTATTYGGGGAGT-3′ R (Bt): 5′-ACTCTAACAAAACATTCCACC-3′ |
58 | 307 | 1: 5′-ATTGATAGATATAGA-3′ 2: 5′-GTTAGTTTGAGTGA-3′ |
4 5 |
SOD2 | F: 5′-GTTAGTGTTGGTGTTATYGTTGATG-3′ R (Bt): 5′-ACTAACCTACAACCTCCTTTCTC −3′ |
58 | 293 | 1: 5′-AGTGTTGGTGTTAT-3′ 2: 5′-AGTTATTATAGTTA-3′ 3: 5′-GGGGAGTAGGGT-3′ 4: 5′-GGGGGTGTTTTG-3′ |
5 8 10 9 |
XRCC1 | F: 5′-GGTTAGAAGGATGAGGTAGAG-3′ R (Bt): 5′-ATCRCTTCTATTACTAAACTCCC-3′ |
55 | 309 | 1: 5′-GTTGGTTAAAGTG-3′ 2: 5′-GATATTGYGTAAGT-3′ |
13 8 |
F: Forward primer; R: Reverse primer; Bt: Biotinylated primer.