. 2017 Aug 2;292(38):15681–15690. doi: 10.1074/jbc.M117.793992

Table 2.

Hydrogen bond between AlgQ2 and alginate oligosaccharide

AlgM1M2SS/AlgQ2 + 6–8M					AlgQ2 + 7–10M					AlgM1M2SS/AlgQ2 + Δ3M					AlgQ2 + Δ3M
Sugar	Atom	Amino acid	Atom	Distance	Sugar	Atom	Amino acid	Atom	Distance	Sugar	Atom	Amino acid	Atom	Distance	Sugar	Atom	Amino acid	Atom	Distance
				Å					Å					Å					Å
M1	O2	Tyr-379	OH	3.0	M1	O2	Asn-375	ND2	3.3	M1	O2	Asn-375	ND2	3.3	M1	O2	Asn-375	ND2	3.1
M1	O2	Tyr-395	OH	3.4	M1	O2	Tyr-395	OH	3.1	M1	O2	Tyr-379	OH	2.9	M1	O2	Tyr-395	OH	3.1
M1	O3	Tyr-395	OH	2.2	M1	O3	Gln-391	NE2	3.2	M1	O3	Tyr-395	OH	2.3	M1	O3	Gln-391	NE2	3.3
M1	O4	Glu-396	OE2	3.5	M1	O3	Tyr-395	OH	2.5	M1	O6A	Ser-273	OG	2.2	M1	O3	Tyr-395	OH	2.6
M1	O6A	Ser-273	OG	3.0	M1	O3	Glu-396	OE1	3.0	M1	O6A	Asn-375	ND2	2.7	M1	O3	Glu-396	OE1	2.7
M1	O6A	Ser-273	N	3.4	M1	O4	Glu-396	OE1	3.5						M1	O5	Asn-375	ND2	3.2
M1	O6B	Ser-273	OG	3.2	M1	O4	Glu-396	OE2	3.1						M1	O6A	Arg-186	NH2	3.5
					M1	O5	Asn-375	ND2	3.4						M1	O6A	Ser-273	OG	2.6
					M1	O6A	Ser-273	OG	2.9						M1	O6A	Asn-375	ND2	3.0
					M1	O6A	Asn-375	ND2	3.2						M1	O6B	Ser-273	N	2.9
					M1	O6B	Ser-273	N	3.0						M1	O6B	Ser-273	OG	3.4
M2	O2	His-187	NE2	3.5	M2	O2	Arg-137	NH2	3.2	M2	O2	Trp-270	NE1	3.0	M2	O2	Trp-270	NE1	3.0
M2	O2	Trp-270	NE1	3.3	M2	O2	Trp-270	NE1	2.6	M2	O2	Arg-137	NH2	3.5	M2	O2	Arg-137	NH2	3.1
M2	O3	Arg-186	NH2	2.6	M2	O3	Arg-186	NH2	3.0	M2	O3	Arg-186	NH2	2.7	M2	O2	His-187	NE2	3.4
M2	O4	Tyr-379	OH	2.9	M2	O3	Trp-270	NE1	3.1	M2	O6A	Tyr-129	OH	3.3	M2	O3	Arg-186	NH2	3.0
M2	O6B	Arg-20	NH2	3.5	M2	O4	Tyr-379	OH	3.5						M2	O3	Trp-270	NE1	3.3
M2	O6B	Tyr-129	OH	3.1	M2	O6B	Tyr-129	OH	2.6						M2	O4	Tyr-379	OH	3.5
															M2	O6A	Tyr-129	OH	2.6
M3	O2	Asp-74	OD2	3.3						M3	O2	Arg-313	NH2	3.3	M3	O1	Asp-74	OD2	3.5
M3	O3	Arg-313	NH2	2.3	M3	O2	Asp-74	OD2	2.9	M3	O4	His-187	NE2	2.8	M3	O1	Asn-75	ND2	2.7
M3	O6A	His-187	NE2	2.8	M3	O3	Arg-313	NH1	3.3	M3	O6A	Lys-22	NZ	2.5	M3	O2	Asp-74	OD2	2.8
M3	O6B	Lys-22	NZ	3.0	M3	O3	Arg-313	NH2	3.3	M3	O6B	Lys-22	NZ	3.3	M3	O3	Arg-313	NH1	3.2
					M3	O6A	His-187	NE2	3.3						M3	O3	Arg-313	NH2	3.2
															M3	O4	His-187	NE2	3.4
															M3	O6A	His-187	NE2	2.7
M4	O3	Asp-21	OD2	3.4	M4	O2	Asp-21	OD2	3.2	M4	O2	Asp-21	OD2	3.4
					M4	O4	Asp-74	OD2	3.4	M4	O3	Arg-20	O	3.5
					M4	O4	Asn-75	ND2	2.9	M4	O4	Asp-74	OD2	3.4
					M4	O6A	Arg-442	NH2	3.2	M4	O6B	Arg-442	NH2	3.0
M5	O1	Thr-443	OG1	2.8	M5	O2	Arg-442	NH1	2.4
M5	O2	Arg-442	NE	2.5	M5	O6A	Asn-53	ND2	3.5
M5	O2	Arg-442	NH2	3.4
M5	O6B	Asn-53	ND2	2.5