Table 2.

Statistics of survival time prediction of KIRC stage-specific protein biomarkers

Protein	Gene	All stages			Stage I			Stage II			Stage III			Stage IV
		p*	FDR	beta	p*	FDR	beta	p*	FDR	beta	p*	FDR	beta	p*	FDR	beta
HSP70	HSPA1A	0.20	0.27	0.11	4.3 × 10 −4	0.05	0.59	0.72	0.97	0.11	0.62	0.79	−0.08	0.89	0.95	−0.02
Rad51	RAD51	3.0 × 10−7	4.0 × 10−6	1.25	8.9 × 10 −4	0.05	1.93	0.35	0.93	1.0	0.06	0.41	0.70	0.03	0.16	1.07
YAP_pS127	YAP1	3.8 × 10−5	2.8 × 10−4	0.67	0.24	0.61	0.48	7.5 × 10 −4	0.08	2.18	0.07	0.41	0.42	0.21	0.42	0.40
STAT5-alpha	STAT5A	0.18	0.26	−0.20	0.90	0.96	0.04	8.9 × 10 −4	0.08	−2.76	0.08	0.41	−0.40	0.19	0.39	−0.31
GAB2	GAB2	2.3 × 10−10	4.1 × 10−8	−0.67	6.9 × 10−3	0.12	−0.55	0.49	0.93	−0.31	4.5 × 10 −5	5.9 × 10−3	−0.78	0.06	0.22	−0.40
MIG-6	ERRFI1	4.2 × 10−10	4.1 × 10−8	−1.12	0.04	0.23	−0.67	0.59	0.93	−0.43	6.3 × 10 −5	5.9 × 10−3	−1.46	0.09	0.29	−0.55
MAPK_ pT202_Y204*	MAPK1, MAPK3	2.3 × 10−8	5.8 × 10−7	−0.53	0.57	0.80	−0.11	0.60	0.93	−0.20	3.0 × 10 −4	0.019	−0.65	0.05	0.20	−0.33
PEA-15	PEA15	2.6 × 10−8	5.8 × 10−7	1.41	0.45	0.74	−0.41	0.03	0.52	1.87	5.0 × 10 −4	0.023	1.59	2.2 × 10−3	0.037	1.38
TIGAR	C12ORF5	1.2 × 10−3	4.5 × 10−3	0.90	0.07	0.33	1.43	0.63	0.93	0.89	0.89	0.94	−0.06	1.3 × 10 −5	1.9 × 10−3	2.74
FASN	FASN	2.0 × 10−6	2.1 × 10−5	0.91	0.87	0.96	0.07	0.30	0.93	0.80	0.34	0.58	0.34	2.3 × 10 −5	1.9 × 10−3	1.29
AR	AR	9.5 × 10−10	5.9 × 10−8	−1.22	1.3 × 10−3	0.05	−1.34	0.92	0.99	−0.07	0.01	0.21	−0.92	3 × 10 −5	1.9 × 10−3	−1.19
S6	RPS6	3.7 × 10−4	1.7 × 10−3	0.70	0.75	0.89	0.12	0.86	0.97	0.14	0.66	0.81	−0.15	8.8 × 10 −5	4.1 × 10−3	1.38
ACC1	ACACA	9.1 × 10−9	2.8 × 10−7	0.88	5.1 × 10−3	0.10	1	0.86	0.97	−0.13	0.19	0.46	0.35	3.6 × 10 −4	0.01	0.86
Cyclin_B1	CCNB1	5.9 × 10−7	7.3 × 10−6	0.60	0.40	0.71	0.32	0.37	0.93	0.37	0.70	0.82	0.10	7.1 × 10 −4	0.02	0.63
GATA3	GATA3	0.02	0.04	0.54	0.51	0.79	0.32	0.49	0.93	0.59	0.17	0.45	0.52	7.4 × 10 −4	0.02	1.07

*p-values were obtained using the log-rank test

p-value in italic indicates the record was significant (nominal p < 0.001)