Table 3.
Reported results for inhibition of 2OG oxygenases by TCA cycle intermediates
Enzyme | Enzyme concentration (μM) | IC50 (μM) |
Kmapp(2OG; μM) | |||
---|---|---|---|---|---|---|
Succinate | Fumarate | D-2HG | L-2HG | |||
KDM4A | 2 [28] | NR | NR | 24 ± 2 [28] | 26 ± 3 [28] | 6 [28] |
KDM4C | 1 [28] | NR | NR | 79 ± 7 [28] | 97 ± 24 [28] | 4 [28] |
KDM4E | 2 [57] | 320 [57] | 2.3 [57] | NR | NR | 13.2 [58] |
KDM2A | 2 [28] | NR | NR | 106 ± 22 [28] | 48 ± 15 [28] | 12.5 [28] |
PHD2 | 0.5 [28] | 19 [29] | 3 [29] | 7300 ± 3300 [28] | 419 ± 150 [28] | 13 ± 2 [45] |
FIH | 1 [28] | > 1000 [29] | > 1000 [29] | 1500 ± 400 [28] | 189 ± 34 [28] | 110 ± 20 [45] |
BBOX | 0.025 [28] | NR | NR | 13,200 ± 1100 [28] | 142 ± 30 [28] | 470 [45] |
ABH2 | 2 [28] | 424 ± 77 [28] | 150 ± 20 [28] | 10 [28] | ||
TET1 | NR | 540 ± 100 [22] | 390 ± 160 [22] | 4000 [26] | 1000 [26] | 55 ± 20 [22] |
TET2 | NR | 570 ± 190 [22] | 400 ± 70 [22] | 5000 [26] | 1600 [26] | 60 ± 15 [22] |
KDM5B | 0.6 | 62 ± 19 | 210 ± 80 | 203 ± 90 | 150 ± 40 | 2.6 ± 0.6 |
NR, not reported. Note that the assays were carried out under different conditions, including with respect to enzyme concentration.