Table 2.
No. | Species | Number of strains | Average number of mazEF/pemIK loci | Occurrence of mazEF/pemIK loci | |||||||||||
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mazEF-Sa | pemIK-Sa1 | pemIK-Sa2 | pemIK-Sa3 | pemIK-Sa4 | pemIK-Sa5 | pemIK-Sa6 | pemIK-Scap | pemIK-Scar | pemIK-Smic | pemIK-Ssci | pemIK-Swar | ||||
1. | S. agnetis | 2 | 1.50 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
2. | S. argenteus | 6 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
3. | S. arlettae | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
4. | S. aureus | 5540 | 1.01 | ■ | ■ | ■ | ■ | ■ | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | ■ |
5. | S. auricularis | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
6. | S. capitis | 13 | 1.31 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ | □ | □ | □ |
7. | S. caprae | 2 | 2.00 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
8. | S. carnosus | 3 | 2.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ | □ | □ |
9. | S. chromogenes | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
10. | S. cohnii | 4 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
11. | S. condimenti | 1 | 2.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ | □ | □ |
12. | S. delphini | 1 | 2.00 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
13. | S. epidermidis | 303 | 1.11 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ | □ | □ | ■ |
14. | S. equorum | 4 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
15. | S. gallinarum | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
16. | S. haemolyticus | 172 | 1.01 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
17. | S. hominis | 8 | 0.88 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
18. | S. hyicus | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
19. | S. intermedius | 1 | 3.00 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ |
20. | S. lentus | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
21. | S. lugdunensis | 7 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
22. | S. massiliensis | 2 | 1.50 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
23. | S. microti | 1 | 2.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ | □ |
24. | S. pasteuri | 3 | 0.67 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
25. | S. pettenkoferi | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
26. | S. pseudintermedius | 4 | 1.25 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
27. | S. saprophyticus | 5 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
28. | S. schleiferi | 4 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
29. | S. schweitzeri | 3 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
30. | S. sciuri | 9 | 2.33 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ |
31. | S. simiae | 1 | 2.00 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
32. | S. simulans | 2 | 2.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ | □ | □ | □ |
33. | S. succinus | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
34. | S. vitulinus | 1 | 1.00 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
35. | S. warneri | 16 | 1.69 | ■ | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | ■ |
36. | S. xylosus | 6 | 0.83 | ■ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ | □ |
Total: 6132 | Average: 1.36 |