Table 3.
Main virulence and resistance gene profiles in S. aureus isolated from nasal samples of livestock (A) and humans (H) in contact with them in three Algerian provinces.
| Virulence Genes | Origin of Isolates | p | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Human (n = 12) n (%) | Horses (n = 5) n (%) | Camels (n = 23) n (%) | Cattle (n = 6) n (%) | Sheep (n = 19) n (%) | Monkeys (n = 1) n (%) | Total Animals (N = 54) n (%) | H vs. A | |
| Virulence genes | ||||||||
| Enterotoxins | ||||||||
| sea | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (16.7) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (1.9) | NS |
| seb | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| egc cluster * | 2 (16.6) | 1 (20) | 1 (4.3) | 2 (33.3) | 0 (0) | 1 (100) | 5 (9.2) | NS |
| seg | 2 (16.6) | 1 (20) | 1 (4.3) | 2 (33.3) | 0 (0) | 1 (100) | 5 (9.2) | NS |
| seh | 1 (8.3) | 2 (40) | 4 (17.4) | 1 (16.7) | 0 (0) | 0 (0) | 7 (12.9) | NS |
| sek | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| seq | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| Other toxins | ||||||||
| tst | 2 (16.6) | 0 (0) | 3 (13) | 2 (33.3) | 7 (36.8) | 0 (0) | 12 (22.2) | NS |
| etA | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| etB | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| etD | 2 (16.6) | 0 (0) | 2 (8.7) | 0 (0) | 4 (21.0) | 0 (0) | 6 (11.1) | NS |
| edinB | 2 (16.6) | 0 (0) | 9 (39.1) | 0 (0) | 7 (36.8) | 0 (0) | 16 (29.6) | NS |
| lukS-PV/lukF-PV | 0 (0) | 0 (0) | 3 (13) | 0 (0) | 4 (21) | 0 (0) | 7 (13) | NS |
| lukDE | 12 (100) | 4 (80) | 10 (43.4) | 5 (83.3) | 10 (52.6) | 1 (100) | 30 (55.5) | 0.002 |
| Hemolysins | ||||||||
| hla | 11 (91.6) | 3 (60) | 21 (91.3) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 50 (92.5) | NS |
| hld | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| hlgA | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| hlg | 5 (41.6) | 1 (20) | 7 (30.4) | 2 (33.3) | 4 (21) | 1 (100) | 15 (27.7) | NS |
| hlgv | 10 (83.3) | 4 (80) | 20 (86.9) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 50 (92.5) | NS |
| MSCRAMMs | ||||||||
| bbp | 12 (100) | 5 (100) | 21 (91.3) | 4 (66.6) | 17 (89.4) | 1 (100) | 48 (88.8) | NS |
| cna | 3 (25) | 3 (60) | 8 (34.7) | 1 (16.7) | 4 (21) | 0 (0) | 16 (29.6) | NS |
| ebpS | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| clfA | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| clfB | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| fib | 7 (58.3) | 3 (60) | 21 (91.3) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 50 (92.5) | 0.007 |
| fnbA | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| fnbB | 10 (83.3) | 4 (80) | 20 (86.9) | 4 (66.6) | 12 (63.1) | 1 (100) | 41 (75.9) | NS |
| Capsule components | ||||||||
| cap5 | 8 (66.6) | 2 (40) | 5 (21.7) | 1 (16.7) | 6 (31.5) | 1 (100) | 15 (27.7) | 0.017 |
| cap8 | 4 (33.3) | 3 (60) | 18 (78.2) | 5 (83.3) | 13 (68.4) | 0 (0) | 39 (72.2) | 0.017 |
| icaA | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| icaC | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| icaD | 12 (100) | 5 (100) | 23 (100) | 6 (100) | 19 (100) | 1 (100) | 54 (100) | NS |
| Other virulence factors | ||||||||
| chp | 7 (58.3) | 1 (20) | 0 (0) | 2 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (5.5) | 0.0001 |
| scn | 8 (66.6) | 1 (20) | 7 (30.4) | 2 (33.3) | 3 (15.8) | 0 (0) | 13 (24) | 0.012 |
| Accessory gene regulators | ||||||||
| agr1 | 7 (58.33) | 3 (60) | 4 (17.4) | 1 (16.7) | 12 (63.1) | 1 (100) | 21 (38.8) | NS |
| agr2 | 3 (25) | 0 (0) | 0 (0) | 4 (66.6) | 0 (0) | 0 (0) | 4 (7.4) | NS |
| agr3 | 2 (16.6) | 2 (40) | 19 (82.6) | 1 (16.7) | 7 (36.8) | 0 (0) | 29 (53.7) | 0.026 |
| agr4 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| Resistance genes | ||||||||
| mecA | 0 (0) | 0 (0) | 2 (8.7) | 0 (0) | 4 (21.0) | 0 (0) | 6 (11.1) | NS |
| mecC | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| blaZ | 11 (91.6) | 5 (100) | 5 (21.7) | 2 (33.3) | 5 (26.3) | 1 (100) | 18 (33.3) | 0.001 |
| ermA | 1 (8.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| ermC | 1 (8.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| aacA-aphD | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | NS |
| tetM | 2 (16.6) | 2 (40) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (3.7) | NS |
| tetK | 3 (25) | 4 (80) | 0 (0) | 2 (33.3) | 5 (26.3) | 0 (0) | 11 (20.3) | NS |
| fosB | 8 (66.6) | 2 (40) | 1 (4.3) | 2 (33.3) | 6 (31.5) | 1 (100) | 12 (22.2) | 0.004 |
* egc cluster corresponds to seg, sei, sem, sen and seo genes.