Table 2.
Nucleotide sequences of primers and PCR conditions used for ChIP
| Gene | Nucleotide sequence | PCR condition | |
|---|---|---|---|
| mFabp4 | ChIP-1F | 5′-TTGGGACCCATTTTTGAAGGG-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min |
| ChIP-1R | 5′-AACTTTGGTTCTCCCTGGCA-3′ | ||
| ChIP-2F | 5′-CAGTCACATGGTCAGGGCAT-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-2R | 5′-TACGGTTGCCAGTTCCACTC-3′ | ||
| ChIP-3F | 5′-GAGTGGAACTGGCAACCGTA-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-3R | 5′-TTCACCTTCCTGTCGTCTGC-3′ | ||
| ChIP-4F | 5′-CCCTGTAGGAGTGGGCTTTG-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-4R | 5′-GGCCTCTTCCTTTGGCTCAT-3′ | ||
| mPLa2g3 | ChIP-1F | 5′-ACATCAGCTTGGGGACATGG-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min |
| ChIP-1R | 5′-TGCAAGGGCGAAATGGTTTG-3′ | ||
| ChIP-2F | 5′-ACAAACCATTTCGCCCTTGC-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-2R | 5′-CCAAACTTTGTCGGTGCCTG-3′ | ||
| ChIP-3F | 5′-AGTCTGGCACGTTTCCTGAG-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-3R | 5′-TTTCTTCTGTCCCCTGCGTC-3′ | ||
| ChIP-4F | 5′-TGCTGGTTTTGACCCCTTGT-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-4R | 5′-GCACCCCTGTGAGGTAGTTC-3′ | ||
| mPLa2g10 | ChIP-1F | 5′-GCTTCCCAGTTCTCAGACCC-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min |
| ChIP-1R | 5′-ATCCCGAAGCCTTCCTACCT-3′ | ||
| ChIP-2F | 5′-AGGTAGGAAGGCTTCGGGAT-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-2R | 5′-TAGCATGTTTGAGGCCCAGG-3′ | ||
| ChIP-3F | 5′-CCTGGGCCTCAAACATGCTA-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-3R | 5′-AGAGAGGCAGGAAGGAGAGG-3′ | ||
| ChIP-4F | 5′-CCTCTCCTTCCTGCCTCTCT-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72°C 5 min | |
| ChIP-4R | 5′-CAGACAGACCCCAGAAGCTG-3′ | ||
| mSpeer-4d | ChIP-1F | 5′-GCTTAATGAGTGTGGCCCCT-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min |
| ChIP-1R | 5′-CTCGGTCACGTAGATCAGGC-3′ | ||
| ChIP-2F | 5′-TGCTCCAAAACCTGTGGTGT-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×32 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-2R | 5′-AGGGAGGGCGTTCTATCCTT-3′ | ||
| ChIP-3F | 5′-AGGATAGAACGCCCTCCCTT-3′ | 96 °C 1 min, 96 °C 30 s, 60 °C 30 s, 72 °C 4 min×40 cycles, 72 °C 5 min | |
| ChIP-3R | 5′-GCTGCTCCTCTTGGACACTT-3′ | ||