Table 2.

Mutations in sarcomatoid ccRCC versus ccRCC across different Fuhrman grades, by P value (Odds Ratio)

Both S- and E-components of sarcomatoid ccRCC vs. ccRCC
Gene	Grade 1	Grade 2	Grade 3	Grade 4	All ccRCC	Grades 1–3*
VHL	0.691(1.72)	0.757(1.12)	0.877(1.07)	0.316(1.55)	0.667(1.15)	0.732(0.91)
BAP1	0.586(3.46)	0.033(2.93)	0.082(2.27)	0.464(0.67)	0.066(2.05)	0.0004(3.17)
SETD2	0.328(4.76)	0.085(2.08)	0.044(2.43)	0.305(1.96)	0.032(2.25)	0.068(1.76)
PBRM1	0.022(0.13)	0.004(0.32)	0.01(0.35)	0.005(0.25)	0.002(0.32)	0.146(0.69)
PTEN	1(1.97)	0.015(5.08)	0.115(2.45)	0.727(1.67)	0.034(3.05)	0.03(2.78)
NF2	1(0.41)	0.244(9.39)	1(1.02)	1(0.8)	0.485(1.78)	0.31(2.35)
RELN	0.462(0.47)	0.003(29.8)	0.014(13.1)	0.378(3.37)	0.006(10.1)	0.007(9.12)
TP53	1(2.32)	0.002(8.12)	0.001(12.1)	0.291(3.06)	0.001(7.96)	0.001(6.8)
UPK3B	0.306(0.23)	0.059(15.9)	0.151(6.3)	0.501(4.16)	0.077(7.3)	0.216(3.54)
HIF1A	1(0.7)	0.149(6.38)	0.06(15.75)	1(0.79)	0.118(4.86)	0.01(14.48)
PTPRD	1(0.41)	0.571(1.56)	0.247(9.28)	1(2.45)	0.328(3.58)	0.532(1.75)
Only E-component of sarcomatoid ccRCC vs. ccRCC
Gene	Grade 1	Grade 2	Grade 3	Grade 4	All ccRCC	Grades 1–3*
VHL	1(1.4)	0.865(0.91)	0.733(0.87)	0.67(1.26)	0.873(0.93)	0.4(0.8)
BAP1	0.573(3.08)	0.072(2.56)	0.168(1.98)	0.429(0.58)	0.189(1.8)	0.001(3.07)
SETD2	0.58(3.59)	0.334(1.54)	0.207(1.79)	0.572(1.45)	0.229(1.66)	0.285(1.42)
PBRM1	0.048(0.17)	0.045(0.43)	0.092(0.47)	0.034(0.33)	0.04(0.43)	0.525(0.82)
PTEN	1(2.14)	0.018(5.46)	0.146(2.63)	0.484(1.8)	0.039(3.28)	0.04(2.81)
NF2	1(0.53)	0.202(12.0)	1(1.31)	1(1.02)	0.41(2.29)	0.265(2.68)
RELN	0.464(0.45)	0.008(29.5)	0.027(12.5)	0.36(3.23)	0.015(9.65)	0.017(8.27)
TP53	1(1.3)	0.098(4.17)	0.059(6.22)	0.676(1.57)	0.067(4.09)	0.032(4.15)
UPK3B	0.14(0.05)	1(3.92)	1(1.28)	1(1.02)	1(1.78)	1(0.79)
HIF1A	1(0.9)	0.104(8.24)	0.041(20.3)	1(1.02)	0.08(6.28)	0.007(16.6)
PTPRD	1(0.53)	0.493(2)	0.204(11.9)	0.494(3.14)	0.27(4.61)	0.492(1.99)

^*Sarcomatoid and grade 4 ccRCC vs grade 1–3 ccRCC.