TABLE 1.

Nonsynonymous and synonymous nucleotide diversity of EV-A71 genes in various tissues of the autopsy case

Tissue or specimen	Diversity value	Result for indicated proteina
		VP4	VP2	VP3	VP1	2A	2B	2C	3A	3B	3C	3D
OG tube	πN	0.000000	0.000181	0.000072	0.000359	0.000340	0.000174*	0.000090	0.000275	0.000146	0.000545	0.000097
	πS	0.000625	0.000351	0.000307	0.001611	0.003251	0.000111	0.000421	0.000460	0.009626	0.005091	0.000557
Throat swab	πN	0.000304	0.000958	0.000180	0.000803	0.000215	0.000000	0.000195	0.001629	0.000000	0.000150	0.000350
	πS	0.001374	0.001389	0.001825	0.000098	0.003374	0.000000	0.001239	0.001489	0.015991	0.003906	0.000360
Intestinal mucosa	πN	0.000000	0.000065	0.000275	0.000405	0.000063	0.000097	0.000123	0.001912	0.000000	0.000219	0.000956
	πS	0.000000	0.000195	0.003767	0.000385	0.004618	0.000795	0.002090	0.000535	0.000000	0.000483	0.003844
Skin lesion	πN	0.000638	0.000028	0.000097	0.000553	0.000078	0.000071	0.000025	0.000987	0.000000	0.000097	0.000379
	πS	0.000000	0.000233	0.000148	0.000226	0.000317	0.000000	0.000485	0.000000	0.015170	0.000411	0.000069
Cervical vertebrae	πN	0.000252	0.000143	0.000066	0.000686	0.000086	0.000276	0.000047	0.003739	0.000000	0.000054	0.000510
	πS	0.000969	0.000000	0.000194	0.000412	0.000459	0.000278	0.000779	0.000000	0.000000	0.000230	0.000302
Medulla oblongata	πN	0.000197	0.000528	0.000112	0.000779	0.000328	0.000203	0.000410	0.002101	0.000000	0.000138	0.000229
	πS	0.000618	0.000351	0.000406	0.000345	0.000920	0.000251	0.000592	0.000000	0.000000	0.001727	0.000368
Basal ganglia	πN	0.000000	0.000174	0.000245	0.000721	0.000000	0.000000	0.000099	0.001578	0.000000	0.000051	0.000705
	πS	0.000000	0.000345	0.000202	0.000628	0.000347	0.000247	0.000081	0.000954	0.000000	0.000729	0.000889

^aBold values represent results for genes for which πN > πS.