Table 1.
ERE Gene Changes Due to TRIM29 Expression in MCF7 Cells
Up-regulated gene | ERE sequence⁎ | Down-regulated gene | ERE sequence⁎ |
---|---|---|---|
AKR1C4 | 5′-GGGTCAATTTaACCa−3′ | BDKRB2 | 5′-tGGTCtGTCTGACCT−3′ |
ALP1 | 5′-AGGTCtGGCTGACCC−3′ | BIRC3 | 5′-AGGgCATATTGACCT−3′ |
ASS | 5′-GGGTgACTCTGACCT−3′ | CXCL2 | 5′-AGGTCtTTATGACCT−3′ |
CALCR | 5′-GGGTCAGTATGACag−3′ | DTNA | 5′-AGaTCAAGGTGACCT−3′ |
CASP8 | 5′-AGGcCATCTTGACCT−3′ | HOXC12 | 5′-AGGTCtTTCTGACCT−3′ |
CD34 | 5′-AGGTCAAATTcACCC−3′ | MATN1 | 5′-GGGTCAGGAccACCC−3′ |
CD86 | 5′-GGGTggGAGTGACCC−3′ | NR4A3 | 5′-GGGTCAGGGcGcCCC−3′ |
CDR1 | 5′-tGGTCACCATcACCT−3′ | PDK4 | 5′-AGGTggCCTTGACCT−3′ |
CPM | 5′-AGGTCACTCTGACCC−3′ | PTGER3 | 5′-GGGaCAGAGTGACCT−3′ |
ELA2A | 5′-AGGgCAGAGTGACCa−3′ | TAC1 | 5′-GGGTCACCCcGcCCC−3′ |
FOS | 5′-AaGTCACCCTGACCT−3′ | THBD | 5′-GGGTggACATGACCC−3′ |
GHRHR | 5′-AGGTCATGTgGACCa−3′ | TRIM31 | 5′-AGaTCAGAATGACCg−3′ |
GREB1 | 5′-GGGTCATTCTGACCT−3′ | WISP2 | 5′-AaGTCgGAGTGACCT−3′ |
HSPD1 | 5′-taGTCAGTGTGACCT−3′ | WNT9B | 5′-GGGTtgCACTGACCC−3′ |
L3MBTL | 5′-GGGTCcTGTTGACCa−3′ | ||
MTHFD2 | 5′-GGcTCACTGTGACCT−3′ | ||
NOS3 | 5′-ctGTCACCTTGACCC−3′ | ||
NUCB2 | 5′-GGGTtgATTTGACCC−3′ | ||
PCHD12 | 5′-GGGTCAACTTGAgCT−3′ | ||
PDE4C | 5′-cGGTCACACaGACCC−3′ | ||
PHF5A | 5′-GGGaCgCCTTGACCT−3′ | ||
PTX3 | 5′-AGGcCAGGCTGACCa−3′ | ||
SHMT2 | 5′-AGaTCAGCCTGACCa−3′ | ||
SLC7A5 | 5′-AaGTCAGAATGACCT−3′ | ||
TCF2 | 5′-AGGTCAATGTGtCCg-3′ | ||
TSHB | 5′-AGGTCAGCTTGACaT-3′ |
Sequences of previously identified EREs are shown with lower case letters denoting nonconserved bases.