Primers	Sense	Antisense
Spike	5′-GCTATCACAGTCCT GCGCTG-3″	5′-CGGGCAGTAAAC CTTCTCATGA-3′
ASF1	5′-CTTTCGTGTGGGTCG GTAGT-3′	5′-CCCCTAACACTTC CTGCGTA-3′
VSG 224	5′-CGATGACGTCAATC CAGATG-3′	5′-CCGTTGGTGTCG TGTCTTC-3′
cSSR - 1	5′-GTATCACCACAGCCC GAACT-3′	5′-GGCAACCGAAAA CAAAGAAA-3′
cSSR - 2	5′-AATTCGCCTACTGTC CATGCCGAT-3′	5′-TGTGCAGAACGCA CATAAGGCAAC-3′
cSSR - 3	5′-GGTAAAGCTGGCGAA GTTGAAGGT-3′	5′-TTTCTTCCGGACA CTCGCGATCAT-3′
cSSR - 4	5′-GGCCTTTATCCGCCG AAATTGGTT-3′	5′-CACTTTGTGGTGA ATCAGCGGCAT-3′
cSSR - 5	5′-AACAACAGACTAAT GGCGGG-3′	5′-TCGATGAATCTG CGCACTAC-3′
dSSR - 1	5′-CCCAATTTCACGGA AGAAAA-3′	5′-CTTGTGGACACG TGACTGCT-3′
dSSR - 2	5′-CGACCCAGCATAAT GTTCCT-3′	5′-GGAAAGTGGACC GTTTTGAA-3′
dSSR - 3	5′-AAGCGGCGTCATTA TTTGCAGACG-3′	5′-ATTGCTTCCACAC CAACCAACGAC-3′
dSSR - 4	5′-TTCACGTGAGAGGT GCATTCCAGT-3′	5′-ACCATGCCGAATT CAGTTGTACCG-3′
dSSR - 5	5′-CACCCAATCCGTCA TTCCACATCA-3′	5′-ACAGTCACAGCTC TCCTTCTCACA-3′
dSSR - 6	5′-TTCGTGTCAACAGG AGGTGCACTA-3′	5′-ACAGATGCCGTAG GTTCATTCGGT-3′