Table 1.
Major Clade | Kingdom | Species | RICTOR | SIN1 | TOR | LST8 | RAPTOR | RHEB | TSC1 | TSC2 | RAG-A/B | RAG-C/D | DEPDC5 | NPRL2 | NPRL3 |
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Opisthokonta | Metazoa | Homo sapiens | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Metazoa | Ciona intestinalis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Metazoa | Drosophila melanogaster | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Metazoa | Schistosoma mansoni | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
Opisthokonta | Metazoa | Caenorhabditis elegans | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||
Opisthokonta | Metazoa | Nematostella vectensis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Metazoa | Trichoplax adhaerens | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Amphimedon queenslandica | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Capsaspora owczarzaki | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Mitosporidium daphniae | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
Opisthokonta | Fungi | Encephalitozoon intestinalis | |||||||||||||
Opisthokonta | Fungi | Rozella allomycis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
Opisthokonta | Fungi | Allomyces macrogynus | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
Opisthokonta | Fungi | Batrachochytrium dendrobatidis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Gonapodya prolifera | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Conidiobolus coronatus | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Smittium culicis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Rhizophagus irregularis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Lobosporangium transversale | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Mortierella elongata | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Mucor circinelloides | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Neocallimastix californiae | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Puccinia sorghi | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Schizophyllum commune | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Cutaneotrichosporon oleaginosus | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Tilletiaria anomala | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Ustilago maydis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Dothistroma septosporum | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Cladophialophora bantiana | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Aspergillus fumigatus | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Trichopyton equinum | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Botrytis cinerea | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Colletotrichum graminicola | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Fusarium fujikuroi | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Neurospora crassa | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Schizosaccharomyces pombe | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Saitoella complicata | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Yarrowia lipolytica | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Candida albicans | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
Opisthokonta | Fungi | Ogataea parapolymorpha | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Eremothecium gossypii | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
Opisthokonta | Fungi | Kluyveromyces lactis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
Opisthokonta | Fungi | Candida glabrata | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
Opisthokonta | Fungi | Saccharomyces cerevisiae | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||
Amoebozoa | Acanthamoeba castellanii | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
Amoebozoa | Dictyostelium discoideum | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||
Amoebozoa | Entamoeba histolytica | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||
Excavata | Naegleria gruberi | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||
Excavata | Bodo saltans | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ 1 | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||
Excavata | Angomonas deanei | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ 1 | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||
Excavata | Trypanosoma brucei | ✔ | ✔ | ✔ 1 | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||
Excavata | Leishmania major | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ 1 | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||
Excavata | Giardia intestinalis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
Excavata | Spironucleus salmonicida | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
SAR | Rhizaria | Reticulomyxa filosa | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
SAR | Rhizaria | Plasmodiophora brassicae | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
SAR | Rhizaria | Bigelowiella natans | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
SAR | Alveolata | Stylonychia lemnae | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||
SAR | Alveolata | Oxytricha trifallax | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||
SAR | Alveolata | Paramecium tetraurelia | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||||
SAR | Alveolata | Tetrahymena thermophila | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||
SAR | Alveolata | Vitrella brassicaformis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
SAR | Alveolata | Plasmodium falciparum | |||||||||||||
SAR | Alveolata | Hammondia hammondi | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
SAR | Alveolata | Toxoplasma gondii | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
SAR | Alveolata | Cyclospora cayetanensis | |||||||||||||
SAR | Alveolata | Eimeria maxima | |||||||||||||
SAR | Alveolata | Cryptosporidium pavrum | |||||||||||||
SAR | Alveolata | Theileria annulata | |||||||||||||
SAR | Stramenopiles | Aureococcus anophagefferens | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||||||
SAR | Stramenopiles | Saprolegnia diclina | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
SAR | Stramenopiles | Aphanomyces invadans | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ |
SAR | Stramenopiles | Pythium irregulare | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
SAR | Stramenopiles | Phytophthora infestans | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
SAR | Stramenopiles | Plasmopara halstedii | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
SAR | Stramenopiles | Hyaloperonospora arabidopsis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
SAR | Stramenopiles | Albugo candida | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |
SAR | Stramenopiles | Nannochloropsis gaditana | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
SAR | Stramenopiles | Blastocystis hominis | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||
SAR | Stramenopiles | Phaeodactylum tricornutum | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||
Plantae | Rhodophyta | Cyanidioschyzon melorae | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||||
Plantae | Rhodophyta | Galdieria sulphuraria | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | ✔ | |||||
Plantae | Rhodophyta | Chondrus crispus | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
Plantae | Chlorophyta | Ostreococcus lucimarinus | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
Plantae | Streptophyta | Selaginella moellendorffii | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
Plantae | Streptophyta | Amborella trichopoda | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
Plantae | Streptophyta | Oryza sativa | ✔ | ✔ | ✔ | ||||||||||
Plantae | Streptophyta | Arabidopsis thaliana | ✔ | ✔ | ✔ |
1 A Trypanosoma brucei protein (NCBI: XP_828034) was experimentally determined as a lethal with sec thirteen 8 (LST8) ortholog, although this protein shows only limited similarity to human and yeast LST8 [6]. The LST8 orthologs in Leishmania major, Bodo saltans, and Angomonas deanei were identified by the NCBI BLAST program with Trypanosoma brucei LST8 as a query. DEPDC5: DEP domain containing 5; NPRL2: nitrogen permease regulator 2-like protein; NPRL3: nitrogen permease regulator 3-like protein; RAPTOR: regulatory associated protein of mTOR; RHEB: Ras homolog enriched in brain; RICTOR: rapamycin-insensitive companion of mTOR; SIN1: stress-activated protein kinase interacting protein 1; TOR: target of rapamycin; TSC1, 2: tuberous sclerosis complex 1, 2.