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. 2017 Dec 16;18(12):2728. doi: 10.3390/ijms18122728

Table 6.

Sequences, efficiencies, and optimal melting temperatures of primers used in this study.

Primer Sequence Eff. Temp.
miR-1-3p 5′-ACACTCCAGCTGGGTGGAATGTAAAGAAGTA-3′ 92.0% 62.5 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCTCCATAC-3′
miR-7-5p 5′-ACACTCCAGCTGGGTGGAAGACTAGTGAT-3′ 96.0% 60.0 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCACAACAA-3′
miR-9a-5p 5′-ACACTCCAGCTGGGTCTTTGGTTATCTAG-3′ 101.4% 58.8 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGTCATACAG-3′
miR-12-5p 5′-ACACTCCAGCTGGGTGAGTATTACATCAGGT-3′ 95.6% 64.5 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCAGTACCT-3′
miR-92a-5p 5′-ACACTCCAGCTGGGAGTCCGTGATGCGTGAC-3′ 88.5% 56.5°C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGATATTGTC-3′
miR-133-3p 5′-ACACTCCAGCTGGGTTGGTCCCCTTCAACCA-3′ 84.3% 64.5 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAG-3′
miR-305-5p 5′-ACACTCCAGCTGGGATTGTACTTCATCAGGT-3′ 91.3% 63.4 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGGAGCACCT-3′
miR-927a-5p 5′-ACACTCCAGCTGGGTTTAGAATTCCTACGCT-3′ 105.3% 60.9 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGTAAAGCGT-3′
miR-989-3p 5′-ACACTCCAGCTGGGTGTGATGTGACGTAGTG-3′ 99.5% 56.9 °C
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCCACTACG-3′
Universal 5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTG-3′ - -

Top and bottom sequences represent forward and stem-loop primers, respectively. Abbreviations: Efficiency (Eff.); Temperature (Temp.).