Table 6.
Primer | Sequence | Eff. | Temp. |
---|---|---|---|
miR-1-3p | 5′-ACACTCCAGCTGGGTGGAATGTAAAGAAGTA-3′ | 92.0% | 62.5 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCTCCATAC-3′ | |||
miR-7-5p | 5′-ACACTCCAGCTGGGTGGAAGACTAGTGAT-3′ | 96.0% | 60.0 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCACAACAA-3′ | |||
miR-9a-5p | 5′-ACACTCCAGCTGGGTCTTTGGTTATCTAG-3′ | 101.4% | 58.8 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGTCATACAG-3′ | |||
miR-12-5p | 5′-ACACTCCAGCTGGGTGAGTATTACATCAGGT-3′ | 95.6% | 64.5 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCAGTACCT-3′ | |||
miR-92a-5p | 5′-ACACTCCAGCTGGGAGTCCGTGATGCGTGAC-3′ | 88.5% | 56.5°C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGATATTGTC-3′ | |||
miR-133-3p | 5′-ACACTCCAGCTGGGTTGGTCCCCTTCAACCA-3′ | 84.3% | 64.5 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAG-3′ | |||
miR-305-5p | 5′-ACACTCCAGCTGGGATTGTACTTCATCAGGT-3′ | 91.3% | 63.4 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGGAGCACCT-3′ | |||
miR-927a-5p | 5′-ACACTCCAGCTGGGTTTAGAATTCCTACGCT-3′ | 105.3% | 60.9 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGTAAAGCGT-3′ | |||
miR-989-3p | 5′-ACACTCCAGCTGGGTGTGATGTGACGTAGTG-3′ | 99.5% | 56.9 °C |
5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTGATGTTCGATGCCATATTGTACTGTGAGCCACTACG-3′ | |||
Universal | 5′-CTCACAGTACGTTGGTATCCTTGTG-3′ | - | - |
Top and bottom sequences represent forward and stem-loop primers, respectively. Abbreviations: Efficiency (Eff.); Temperature (Temp.).