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. Author manuscript; available in PMC: 2019 Jan 16.
Published in final edited form as: Anal Chem. 2018 Jan 3;90(2):1223–1233. doi: 10.1021/acs.analchem.7b03912

Table 2.

Identified AGP N-glycopeptides with Site II and V by reversed-phase UHPLC-ESI-MS/MS and reversed-phase UHPLC-CZE-ESI-MS/MS

Peptide Sequence Glycoform Theoretical m/z Observed m/z
Reversed-phase UHPLC-ESI-MS/MS Reversed-phase UHPLC-CZE-ESI-MS/MS
NEEYN38K Asialylated G4500 806.9800 (3+) 806.9841 (3+) 806.9800 (3+)
G4510 855.6660 (3+) × 855.6675 (3+)
G5600 928.6907 (3+) × 928.6913 (3+)
Monosialylated G3401 1172.9476 (2+) × 1172.9479 (2+)
G4401 849.9942 (3+) × 849.9919 (3+)
G4501 904.0118 (3+) 904.0175 (3+) 904.0110 (3+)
G4511 952.6978 (3+) 952.7016 (3+) 952.6961 (3+)
G5601 1025.7225 (3+) 1025.7286 (3+) 1025.7202 (3+)
G5611 1074.4085 (3+) 1074.4156 (3+) 1074.4064 (3+)
G6701 1147.4333 (3+) 1147.4392 (3+) 1147.4376 (3+)
G6711 1196.1192 (3+) × 1196.1154 (3+)
Bisialylated G4502 1001.0436 (3+) 1001.0496 (3+) 1001.0468(3+)
G4512 1049.7296 (3+) 1049.7356 (3+) 1049.7297(3+)
G5502 1068.7367 (3+) × 1068.7313(3+)
G5602 1122.7543 (3+) 1122.7606 (3+) 1122.7540 (3+)
G5612 1171.4403 (3+) 1171.4470 (3+) 1171.4415 (3+)
G6702 1244.465 (3+) 1244.4731 (3+) 1244.4539 (3+)
Trisialylated G5603 1219.7861 (3+) 1219.7919 (3+) 1219.7837 (3+)
G5613 1268.4721 (3+) 1268.4785 (3+) 1268.4686 (3+)
G5623 1317.1581 (3+) 1317.1625 (3+) 1317.1570 (3+)
G6703 1341.4969 (3+) × 1341.4994 (3+)
G6713 1390.1828 (3+) × 1390.1760 (3+)
EN85GTISR Asialylated G4500 1199.9873 (2+) × 1199.9850 (2+)
Monosialylated G4501 897.3593 (3+) 897.3635 (3+) 897.3583 (3+)
G5601 1019.0700 (3+) × 1019.0710 (3+)
G5611 1067.7560 (3+) × 1067.7578 (3+)
G6701 1140.7808 (3+) 1140.7877 (3+) 1140.7837 (3+)
G6711 1189.4667 (3+) × 1189.4662 (3+)
G6721 1238.1527 (3+) × 1238.1527 (3+)
G7801 1262.4915 (3+) × 1262.4904 (3+)
G7811 1311.1775 (3+) × 1311.1776 (3+)
Bisialylated G4502 994.3911 (3+) 994.3967 (3+) 994.3925 (3+)
G5602 1116.1018 (3+) 1116.1080 (3+) 1116.0985 (3+)
G5612 1164.7878 (3+) 1164.7932 (3+) 1164.7898 (3+)
G6702 1237.8234 (3+) 1237.8234 (3+) 1237.8124 (3+)
G6712 1286.5132 (3+) 1286.5132 (3+) 1286.5021 (3+)
Trisialylated G5603 1213.1336 (3+) 1213.1404 (3+) 1213.1299 (3+)
G5613 1261.8196 (3+) 1261.8257 (3+) 1261.8143 (3+)
G5623 1310.5056 (3+) 1310.5090 (3+) 1310.5037 (3+)
G6703 1334.8444 (3+) 1334.8511 (3+) 1334.8402 (3+)
G6713 1383.5303 (3+) 1383.5378 (3+) 1383.5253 (3+)
G6723 1432.2163 (3+) × 1432.2021 (3+)
G6733 1480.9023 (3+) × 1480.8983 (3+)
G7803 1456.5551 (3+) 1456.5598 (3+) 1456.5485 (3+)
G7813 1505.2411 (3+) × 1505.2319 (3+)
Tetrasialylated G6704 1431.8762 (3+) 1431.8826 (3+) 1431.8717 (3+)
G6714 1480.5621 (3+) 1480.5699 (3+) 1480.5583 (3+)
G6724 1529.2481 (3+) 1529.2537 (3+) 1529.2448 (3+)
G6734 1577.9341 (3+) 1577.9352 (3+) 1577.9226 (3+)
G7804 1553.5869 (3+) 1553.5935 (3+) 1553.5856 (3+)
G7814 1201.9566 (4+) 1201.9644 (4+) 1201.9531 (4+)
G7824 1238.4711 (4+) × 1238.4658 (4+)
G7834 1274.9856 (4+) × 1274.9803 (4+)
G8904 1256.7261 (4+) 1256.7307 (4+) 1256.7178 (4+)
G8914 1293.2397 (4+) 1293.2472 (4+) 1293.2349 (4+)
G8924 1329.7542 (4+) × 1329.7559 (4+)
G9(10)04 1348.0083 (4+) × 1348.0022 (4+)
G9(10)14 1384.5227 (4+) × 1384.5321 (4+)
Pentasialylated G8905 1329.4990 (4+) × 1329.5043 (4+)
G8915 1366.0135 (4+) × 1366.0149 (4+)
G8925 1402.5280 (4+) × 1402.5204 (4+)
G9(10)05 1420.7821 (4+) × 1420.7756 (4+)
C9(10)15 1457.2966 (4+) × 1457.2939 (4+)
EN85GTVSR Monosialylated G4501 892.6874 (3+) × 892.6888 (3+)
G5601 1014.3982 (3+) 1014.4027 (3+) 1014.3954 (3+)
G5611 1063.0841 (3+) 1063.0928 (3+) 1063.0844 (3+)
G6701 1136.1089 (3+) 1136.1135 (3+) 1136.1073 (3+)
G6711 1184.7949 (3+) 1184.7996 (3+) 1184.7943 (3+)
Bisialylated G4502 989.7192 (3+) 989.7225 (3+) 989.7205 (3+)
G5602 1111.4230 (3+) 1111.4332 (3+) 1111.4310 (3+)
G5612 1160.1159 (3+) 1160.1206 (3+) 1160.1124 (3+)
G6702 1233.1407 (3+) 1233.1456 (3+) 1233.1334 (3+)
G6712 1281.8267 (3+) 1281.8317 (3+) ×
Trisialylated G5603 1208.4618 (3+) 1208.4672 (3+) 1208.4576 (3+)
G5613 1257.1477 (3+) 1257.1548 (3+) 1257.1482 (3+)
G6703 1330.1725 (3+) 1330.1768 (3+) 1330.1670 (3+)
G6713 1378.8585 (3+) 1378.8638 (3+) 1378.8590 (3+)
G6723 1427.5444 (3+) × 1427.5387 (3+)
Tetrasialylated G6704 1427.2043 (3+) 1427.2097 (3+) 1427.1981 (3+)
G6714 1475.8903 (3+) 1475.8972 (3+) 1475.8844 (3+)
G6724 1524.5762 (3+) 1524.5873 (3+) 1524.5752 (3+)
G7804 1548.9150 (3+) 1549.2635 (3+) 1548.9236 (3+)
G7814 1198.4527 (4+) 1198.4531 (4+) 1198.4491 (4+)
G7824 1234.9672 (4+) × 1234.9587 (4+)
G8904 1253.2222 (4+) 1253.2255 (4+) 1253.2178 (4+)
G8914 1289.7358 (4+) 1269.7380 (4+) 1289.7334 (4+)
G9(10)04 1344.5044 (4+) × 1344.7554 (4+)
G9(10)14 1381.0188(4+) × 1381.2648 (4+)
Pentasialylated G8905 1325.9951 (4+) × 1326.0023 (4+)
G8915 1362.5096 (4+) × 1362.5182 (4+)
G8925 1399.0241 (4+) × 1339.0211 (4+)
G9(10)05 1417.2782 (4+) × 1417.2744 (4+)