Table 4.
Antigenic Site A Variation Among Human sH3N2 Viruses and 2012–2013 H3N2v Viruses
| Amino Acid Residues in Antigenic Site Aa
|
Glycosylation Sites, No.b |
Accession No.c |
||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Strain | 122 | 124 | 126 | 131 | 133 | 135 | 137 | 138 | 140 | 142 | 143 | 144 | 145 | 146 | ||
| sH3N2 viruses | ||||||||||||||||
| SH/87 | N | D | Nd | T | S | G | Y | A | K | G | S | V | N | S | 1 | AF008886 |
| BJ/92 | … | … | … | A | D | … | … | … | … | … | … | … | … | … | 1 | CY113677 |
| WH/95 | … | G | … | A | D | T | … | … | … | … | … | … | K | … | 1 | EU501120 |
| SY/97 | Nd | S | … | A | Nd | T | … | … | … | S | … | I | K | … | 3 | CY112885 |
| BR/07 | Nd | S | … | … | Nd | T | S | … | I | R | … | Nd | … | … | 4 | EU199366 |
|
| ||||||||||||||||
| H3N2v viruses | ||||||||||||||||
| OH/13/12 | Q | S | … | A | D | Y | … | … | R | … | … | … | … | … | 1 | EPI381857 |
| IN/6/13 | Q | S | … | A | D | Y | … | … | R | … | … | … | K | … | 1 | EPI461874 |
| IN/17/13 | Q | S | … | A | D | Y | … | … | R | … | … | … | R | … | 1 | EPI462212 |
Abbreviations: H3N2v, influenza A(H3N2) variant; IN/6/13, A/Indiana/06/2013; IN/17/13, A/Indiana/17/2013; OH/13/12, A/Ohio/13/2012; sH3N2, human seasonal influenza A(H3N2).
a
The aa sequence in antigenic site A; ellipses denote sequence identical to that for SH/87 virus.
b
Numbers of potential glycosylation sites in antigenic site A.
c
Hemagglutinin sequences were accessed from the National Center for Biotechnology Information or the GISAID database.
d
Potential glycosylation sites (N-X-S/T).