Skip to main content
. 2018 Feb 6;18:30. doi: 10.1186/s12870-018-1249-x

Table 3.

List of shared frameshift mutations and stop codons

Gene Species Amino Acid SC or FS
ndhA B. americana 19 SC
S. hermonthica 20 SC
S. aspera 20 SC
ndhB S. hermonthica 24 FS
S. aspera 24 FS
S. hermonthica 118 SC + FS
S. aspera 118 SC + FS
ndhD S. hermonthica 94 FS
S. aspera 94 FS
S. hermonthica 116 FS
S. aspera 116 FS
S. hermonthica 152 FS
S. aspera 152 FS
S. forbessii 269 FS
S. hermonthica 269 FS
S. aspera 269 FS
S. hermonthica 319 FS
S. aspera 317 FS
S. hermonthica 358 FS
S. aspera 356 FS
S. hermonthica 372 FS
S. aspera 370 FS
S. hermonthica 391 FS
S. aspera 389 FS
S. hermonthica 425 FS
S. aspera 424 FS
ndhF S. hermonthica 3 SC
S. aspera 3 SC
S. forbessii 20 SC
S. hermonthica 20 SC
S. aspera 20 SC
S. hermonthica 81 FS
S. aspera 91 FS
S. forbessii 617 FS
S. aspera 593 FS
ndhI B. americana 90 SC
S. forbessii 89 SC
S. hermonthica 90 SC
S. aspera 90 SC
S. hermonthica 112 FS
S. aspera 112 FS
ndhK S. hermonthica 3 FS
S. aspera 3 FS
accD B. americana 57 FS
S. forbessii 12 FS
S. hermonthica 12 FS
S. aspera 59 FS
B. americana 92 FS
S. forbessii 47 FS
S. hermonthica 47 FS
S. aspera 129 FS
ycf1 B. americana 251 FS
S. forbessii 256 FS
S. hermonthica 258 FS
S. aspera 254 FS
B. americana 360 FS
S. forbessii 386 FS
S. hermonthica 392 FS
S. aspera 391 FS
S. forbessii 467 FS
S. hermonthica 491 FS
S. aspera 475 FS
B. americana 674 FS
S. forbessii 648 FS
S. hermonthica 661 FS
S. aspera 660 FS
S. hermonthica 1288 FS
S. aspera 1287 FS
S. hermonthica 1452 SC
S. aspera 1451 SC
S. hermonthica 1462 FS
S. aspera 1461 FS
ycf2 S. hermonthica 482 FS
S. aspera 489 FS
B. americana 848 FS
S. forbessii 1024 FS
S. hermonthica 987 FS
S. aspera 994 FS

List of frameshift mutations (FS) and stop codons (SC) that are shared by two or more species and the amino acid position in each species. FS and SC in the same box are the result of the identical nucleotide mutation in each species. Stop codons created by frameshift mutations are not included. S. forbessii is missing the first exon of ndhA, which contains the shared stop codon at the 20th amino acid in the other three species. ndhE does not have any shared mutations, but B. americana, S. hermonthica, and S. aspera have independent insertions at the same aligned amino acid position (35 in B. americana and 33 in the two Striga species)