Table 3.
Gene | Species | Amino Acid | SC or FS |
---|---|---|---|
ndhA | B. americana | 19 | SC |
S. hermonthica | 20 | SC | |
S. aspera | 20 | SC | |
ndhB | S. hermonthica | 24 | FS |
S. aspera | 24 | FS | |
S. hermonthica | 118 | SC + FS | |
S. aspera | 118 | SC + FS | |
ndhD | S. hermonthica | 94 | FS |
S. aspera | 94 | FS | |
S. hermonthica | 116 | FS | |
S. aspera | 116 | FS | |
S. hermonthica | 152 | FS | |
S. aspera | 152 | FS | |
S. forbessii | 269 | FS | |
S. hermonthica | 269 | FS | |
S. aspera | 269 | FS | |
S. hermonthica | 319 | FS | |
S. aspera | 317 | FS | |
S. hermonthica | 358 | FS | |
S. aspera | 356 | FS | |
S. hermonthica | 372 | FS | |
S. aspera | 370 | FS | |
S. hermonthica | 391 | FS | |
S. aspera | 389 | FS | |
S. hermonthica | 425 | FS | |
S. aspera | 424 | FS | |
ndhF | S. hermonthica | 3 | SC |
S. aspera | 3 | SC | |
S. forbessii | 20 | SC | |
S. hermonthica | 20 | SC | |
S. aspera | 20 | SC | |
S. hermonthica | 81 | FS | |
S. aspera | 91 | FS | |
S. forbessii | 617 | FS | |
S. aspera | 593 | FS | |
ndhI | B. americana | 90 | SC |
S. forbessii | 89 | SC | |
S. hermonthica | 90 | SC | |
S. aspera | 90 | SC | |
S. hermonthica | 112 | FS | |
S. aspera | 112 | FS | |
ndhK | S. hermonthica | 3 | FS |
S. aspera | 3 | FS | |
accD | B. americana | 57 | FS |
S. forbessii | 12 | FS | |
S. hermonthica | 12 | FS | |
S. aspera | 59 | FS | |
B. americana | 92 | FS | |
S. forbessii | 47 | FS | |
S. hermonthica | 47 | FS | |
S. aspera | 129 | FS | |
ycf1 | B. americana | 251 | FS |
S. forbessii | 256 | FS | |
S. hermonthica | 258 | FS | |
S. aspera | 254 | FS | |
B. americana | 360 | FS | |
S. forbessii | 386 | FS | |
S. hermonthica | 392 | FS | |
S. aspera | 391 | FS | |
S. forbessii | 467 | FS | |
S. hermonthica | 491 | FS | |
S. aspera | 475 | FS | |
B. americana | 674 | FS | |
S. forbessii | 648 | FS | |
S. hermonthica | 661 | FS | |
S. aspera | 660 | FS | |
S. hermonthica | 1288 | FS | |
S. aspera | 1287 | FS | |
S. hermonthica | 1452 | SC | |
S. aspera | 1451 | SC | |
S. hermonthica | 1462 | FS | |
S. aspera | 1461 | FS | |
ycf2 | S. hermonthica | 482 | FS |
S. aspera | 489 | FS | |
B. americana | 848 | FS | |
S. forbessii | 1024 | FS | |
S. hermonthica | 987 | FS | |
S. aspera | 994 | FS |
List of frameshift mutations (FS) and stop codons (SC) that are shared by two or more species and the amino acid position in each species. FS and SC in the same box are the result of the identical nucleotide mutation in each species. Stop codons created by frameshift mutations are not included. S. forbessii is missing the first exon of ndhA, which contains the shared stop codon at the 20th amino acid in the other three species. ndhE does not have any shared mutations, but B. americana, S. hermonthica, and S. aspera have independent insertions at the same aligned amino acid position (35 in B. americana and 33 in the two Striga species)