Table 1.
Zinc-dependent HDACs
| Compound | Class I | Class IIa | Class IIb | Class IV | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HDACl | HDAC2 | HDAC3 | HDAC8 | HDAC4 | HDAC5 | HDAC7 | HDAC9 | HDAC6 | HDAC10 | HDAC11 | |
| Tacedinaline | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| MC1568 | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Pyroamide | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Romidepsin | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| CUCD-907 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Entinostat | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| RG2833 | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| SBHA | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| RGFP 966 | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 45C-202 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| BG45 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Resminostat | + | − | + | − | − | − | − | − | + | − | − |
| Tasquinimod | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| LMK-235 | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − |
| Rocilinostat | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| BRD 73994 | − | − | − | + | − | − | − | − | + | − | − |
| Droxinostat | − | − | + | + | − | − | − | − | + | − | − |
| Mocetinostat | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + |
| PCl-34051 | + | − | − | + | − | − | − | − | + | + | − |
| PCl-24781 | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − |
| VPA | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − |
| Pracinostat | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + |
| Trichostatin A | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | + |
| CUDC-101 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| Quisinostat | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| Belinostat | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| Vorinostat | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
HDAC inhibitors and their specific targets used for the systematic bioenergetics screen in kcna1-MO are presented.