Table 1.
PVY SON41p |
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93 | 94 | 95 | 96 | 98 | 100 | 101 | 102 | 105 | 108 | 114 | 115 | 117 | 118 | 119 | 121 | 123 | |||
I | R | D | I | E | F | S | E | R | V | E | T | A | L | D | H | S | |||
VPg group C polymorphic sites | 93 | V | – | ||||||||||||||||
94 | G | d | |||||||||||||||||
95 | E, N | d | |||||||||||||||||
96 | V | – | |||||||||||||||||
98 | D | – | |||||||||||||||||
100 | L | d | |||||||||||||||||
101 | G | RB | |||||||||||||||||
102 | Q | o | |||||||||||||||||
105 | K | RB* | |||||||||||||||||
108 | I | – | |||||||||||||||||
114 | Q | o | |||||||||||||||||
115 | A, M, R, T | RB | |||||||||||||||||
117 | V | – | |||||||||||||||||
118 | V | – | |||||||||||||||||
119 | S, E, H | RB | |||||||||||||||||
121 | N | RB* | |||||||||||||||||
123 | K, E, N, T | RB* |
Second and third line/column: polymorphic amino acid sites and their corresponding positions in VPg protein sequence. Red/blue boxes: amino acids substitutions that are predicted (PONDR-VLXT) to enhance or reduce intrinsic disorder content in VPg-SON41p respectively. “d” and “o”: respectively intrinsic disorder and order promoting substitutions; “RB”: pvr23-resistance breaking sites previously identified (Ayme et al. 2006; Montarry et al. 2011); “RB*”: expected resistance-breaking sites (displaying high dN/dS ratios; Ayme et al. 2007; Moury et al. 2014).