Skip to main content
. 2018 Mar 8;9:395. doi: 10.3389/fimmu.2018.00395

Table 2.

Analyses of (A) DeKosky and (B) DeWitt data for identical HCDR3s.

(A)

HCDR3 aa sequence Length VH family VH gene DH gene JH gene

CAKDGYW 5 IGHV01 IGHV1-46 IGHJ4
CAKDGYW 5 IGHV03 IGHV3-23 IGHJ4
CARADDAFDIW 9 IGHV01 IGHV1-69 IGHJ3
CARADDAFDIW 9 IGHV04 IGHV4-34 IGHD1-1 IGHJ3
CARALYYFDYW 9 IGHV01 IGHV1-46 IGHD1-7 IGHJ4
CARALYYFDYW 9 IGHV01 IGHV1-2 IGHD3-16 IGHJ4
CARDKYYFDYW 9 IGHV01 IGHV1-69 IGHD1-14 IGHJ4
CARDKYYFDYW 9 IGHV04 IGHV4-59 IGHJ4
CARDLDYW 6 IGHV03 IGHV3-11 IGHJ4
CARDLDYW 6 IGHV03 IGHV3-33 IGHJ4
CARDPFDYW 7 IGHV01 IGHV1-69 IGHJ4
CARDPFDYW 7 IGHV01 IGHV1-46 IGHJ4
CARDPGPW 6 IGHV01 IGHV1-69 IGHD1-14 IGHJ5
CARDPGPW 6 IGHV03 IGHV3-33 IGHD1-14 IGHJ5
CARDRSSSFDYW 10 IGHV03 IGHV3-33 IGHD6-13 IGHJ4
CARDRSSSFDYW 10 IGHV03 IGHV3-74 IGHD6-13 IGHJ4
CARDSGNDYW 8 IGHV07 IGHV7-4 IGHD6-13 IGHJ4
CARDSGNDYW 8 IGHV01 IGHV1-8 IGHD4-23 IGHJ4
CARDSSGYFDYW 10 IGHV01 IGHV1-46 IGHD3-22 IGHJ4
CARDSSGYFDYW 10 IGHV01 IGHV1-18 IGHD3-22 IGHJ4
CARDYCSGGSCYFDYW 14 IGHV04 IGHV4-31 IGHD2-15 IGHJ4
CARDYCSGGSCYFDYW 14 IGHV03 IGHV3-21 IGHD2-15 IGHJ4
CARGAAPDYW 8 IGHV01 IGHV1-46 IGHD5-12 IGHJ4
CARGAAPDYW 8 IGHV03 IGHV3-53 IGHD2-15 IGHJ4
CARGAYYFDYW 9 IGHV04 IGHV4-59 IGHD3-16 IGHJ4
CARGAYYFDYW 9 IGHV03 IGHV3-33 IGHJ4
CARGGNWFDPW 9 IGHV04 IGHV4-34 IGHD3-10 IGHJ5
CARGGNWFDPW 9 IGHV04 IGHV4-30 IGHD2-15 IGHJ5
CARGGYGDYVDYW 11 IGHV01 IGHV1-46 IGHD4-17 IGHJ4
CARGGYGDYVDYW 11 IGHV01 IGHV1-18 IGHD4-17 IGHJ4
CARGIAAADYW 9 IGHV03 IGHV3-48 IGHD6-13 IGHJ4
CARGIAAADYW 9 IGHV01 IGHV1-69 IGHD6-13 IGHJ4
CARGRVFDYW 8 IGHV04 IGHV4-34 IGHD3-16 IGHJ4
CARGRVFDYW 8 IGHV02 IGHV2-5 IGHD1-26 IGHJ4
CARGSSFDYW 8 IGHV04 IGHV4-59 IGHD3-10 IGHJ4
CARGSSFDYW 8 IGHV03 IGHV3-53 IGHD6-6 IGHJ4
CARGVAARDYW 9 IGHV04 IGHV4-59 IGHD6-6 IGHJ4
CARGVAARDYW 9 IGHV03 IGHV3-48 IGHD6-6 IGHJ4
CARRFDPW 6 IGHV03 IGHV3-21 IGHJ5
CARRFDPW 6 IGHV04 IGHV4-34 IGHJ5
CARRLGNWYFDLW 11 IGHV03 IGHV3-11 IGHD3-10 IGHJ2
CARRLGNWYFDLW 11 IGHV04 IGHV4-61 IGHD7-27 IGHJ2
CARVGSGWYFDYW 11 IGHV03 IGHV3-66 IGHD6-19 IGHJ4
CARVGSGWYFDYW 11 IGHV03 IGHV3-7 IGHD6-19 IGHJ4
CASNDAFDIW 8 IGHV01 IGHV1-46 IGHJ3
CASNDAFDIW 8 IGHV05 IGHV5-10 IGHJ3

(B)

HCDR3 aa Sequence # rearrangements VH family VH gene DH gene JH gene Donor representation

CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-02 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-02 IGHD05-24 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-03 IGHD01-26 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-03 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-03 IGHD06-25 IGHJ04-01 donor1
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-18 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-18 IGHD03-16 IGHJ04-01 donor1, donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-18 IGHD05-24 IGHJ04-01 donor2
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-18 IGHD06-25 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-46 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1, donor2, donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-46 IGHD03-16 IGHJ04-01 donor2
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-69 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1, donor2, donor3
CARDRGDYW 26 IGHV01 IGHV01-69 IGHD03-16 IGHJ04-01 donor2
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-11 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-11 IGHD03-16 IGHJ04-01 donor1
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-13 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-48 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-53 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1, donor3
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-53 IGHD03-16 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-53 IGHD05-24 IGHJ04-01 donor1
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-64 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1, donor3
CARDRGDYW 26 IGHV03 IGHV03-66 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor2, donor3
CARDRGDYW 26 IGHV04 IGHV04-39 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor1, donor3
CARDRGDYW 26 IGHV04 IGHV04-39 IGHD03-16 IGHJ04-01 donor3
CARDRGDYW 26 IGHV05 IGHV05-51 IGHD03-16 IGHJ04-01 donor2
CARDRGDYW 26 IGHV07 IGHV07-04 IGHD03-10 IGHJ04-01 donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV01 IGHV01-02 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor2, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV01 IGHV01-03 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor2, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV01 IGHV01-08 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV01 IGHV01-18 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor2, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV01 IGHV01-46 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV01 IGHV01-69 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor2, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV02 IGHV02-70 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-11 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-20 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-23 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-48 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-53 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor2, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-64 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-66 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor2, donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-72 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV03 IGHV03-74 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor2
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV04 IGHV04-39 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV05 IGHV05-51 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor3
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV06 IGHV06-01 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor1, donor2
CARDSSGWYYFDYW 20 IGHV07 IGHV07-04 IGHD06-19 IGHJ04-01 donor3