Table 3.
ID | ART | AIDS | Viral load | CD4 cells/ul | Nef | Gag | Pol | Protease | Rev | RT | Tat | Vif | p1 | p24 | p17 | Poly | Vpu | Env | Vpr | Vif |
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copies/ml | ||||||||||||||||||||
22 | No | 224 | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | ||||||||
27 | Yes | AIDS | <50 | 134 | X | |||||||||||||||
28 | Yes | AIDS | 280100 | 22 | X | X | X | X | X | |||||||||||
30 | Yes | AIDS | >10000 | <20 | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | ||||||
41 | Yes | 29187 | 440 | X | X | X | ||||||||||||||
46 | Yes | <50 | 689 | X | X | X | X | |||||||||||||
45 | Yes | 400 | 345 | X | X | X | X | X | ||||||||||||
48 | Yes | 4974 | 454 | X | X | X | X | |||||||||||||
51 | NA | NA | X | X | X | X | X | |||||||||||||
52 | Yes | 51 | 574 | X | X | X | X | X | X | X | X | |||||||||
61 | <50 | 655 | X | X | ||||||||||||||||
62 | Yes | AIDS | <50 | 232 | X | |||||||||||||||
63 | No | 2023 | 83 | X | ||||||||||||||||
65 | No | NA | NA | X | ||||||||||||||||
66 | No | NA | NA | X | ||||||||||||||||
67 | Yes | 75 | 509 | X | ||||||||||||||||
68 | No | NA | NA | X | ||||||||||||||||
69 | Yes | <50 | 187 | X | ||||||||||||||||
70 | Yes | <50 | 399 | X | ||||||||||||||||
71 | Yes | <50 | 456 | X | ||||||||||||||||
74 | NA | NA | X | |||||||||||||||||
86 | Yes | <75 | 1642 | X | X | X | X | |||||||||||||
103 | Yes | AIDS | 150 | 560 | X | X | X | |||||||||||||
104 | Yes | AIDS | 77 | 313 | X | X | ||||||||||||||
108 | Yes | AIDS | <50 | 653 | X | X | X | |||||||||||||
110 | Yes | <50 | 379 | X | X | |||||||||||||||
111 | Yes | AIDS | <50 | 182 | X | X | ||||||||||||||
112 | Yes | AIDS | >200 | 581 | X | X | ||||||||||||||
142 | Yes | <50 | 487 | X | X | X | X | X | X | X | X | |||||||||
173-1 | Yes | <50 | 398 | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | |||||||
173-2 | Yes | <50 | 398 | X | X | X | X | X | X | |||||||||||
174-1 | Yes | 48 | 315 | X | X | X | X | X | X | |||||||||||
174-2 | Yes | 48 | 315 | X | X | X | X | |||||||||||||
196-1 | Yes | AIDS | <50 | 113 | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | |||
196-2 | Yes | AIDS | <50 | 113 | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X |
An initial protein identification list was generated from matches with an Xcorr score versus charge state of 1.0 (+1), 1.5 (+2), and 1.7 (+3) and consensus scores greater than 10.0; NA = not available.