Table 3. L2. Primers sequences and annealing temperatures.

Target Region	HPV type	PCR primers and assay conditions			Pyrosequencing primers
		PCR primer a	Ampl. bp	PCR ann. T	Sequencing a primer	HPV strand
L2 b	16	Forward GTTAGGTGGATATGTATTTGTT Reverse bio- ATACCATTATTTTTAATACATACACATAC	276	58	ATGTTTTATAAAGTTGGG	Lower
	18	Forward AGGTTGGTTTATATAGTGTATTGT Reverse bio- ATACCTATACCAAATCCACC	263	56	TTGTATTTTTATAATAAAATTATGG	Upper
	31	Forward TGGATAAGTATTTGTTGTTTTATATGTT Reverse bio- CCATTATTTATAATTCATACACATACAT	235	50	TTTGATATAATTGTGTAGTAG	Lower
	33	Forward GGTTTTGTATGTTTGGTATAGTT Reverse bio- ACTAATAAATACCTTTATATTTTAACAAT	106	50	GTATAGTTGTGTTGTAGATG	Lower
	35	Forward TGGATAAGTTTTTGTAGTTTTGTAA Reverse bio- AATAAATTAATCACATAATATAACCATAC	112	48	TAGTTGTGTTGTAGATG	Lower
	39	Forward bio- ATAGGTTTTATATAGGTTAGTTGTAGA Reverse ACCACACCATTAAAAATATTTTATA	226	56	AATAAACATAATTTCCCACC	Lower
	45	Forward bio- TATGTTTTATATAAGTTAGTTGTAGA Reverse ACATCCCCATTAACAACATTTACTA	269	56	AACCATAATATCCCACC	Lower
	51	Forward GTTTTTGGTTTGTTGTTGTAATATTTTAA Reverse bio- AACCCACTCCACTATAATATTTTATC	87	56	TTGTGATTAAATATGGTGG	Upper
	52	Forward GTTAGAGGTTTTGTATGTTTGATATAG Reverse bio- ATTTTCCAATATTTTATATTCACTATCAT	239	50	ATATAGTTGTGTTGTAGAA	Lower
	56	Forward TTGGATATGTATTAGATAATTTATATGTT Reverse bio- ACCACATCCTTTTTTAATACATTTATA	209	48	ATATAGTTGTGTTGTAGA	Lower
	58	Forward GGTTTTGTATGTTTGGTAAAGTT Reverse bio- CATACACAATACTTAACCCAAC	221	58	GGTAAAGTTGTGTAGTAGA	Lower
	59	Forward GGGTATGTATTTGTTTGTTTGTAG Reverse bio-AATACTATATACCCATACAATACTATCC	221	56	AAGTTTGTTGTTGAGG	Lower

^a Bisulfite modified sequences

^b L2. HPV L2 gene. Reference HPV16 CpG: 4261