Skip to main content
. 2018 Feb 9;8(4):1225–1245. doi: 10.1534/g3.117.300524

Table 2. Repeatabilities within each single and across all provenances as given by r ± SD.

Provenance Measure Rt Rc Rs rRs
b03 σα2 0.011 ± 0.088 0.043 ± 0.114 0.000 ± 0.000 0.053 ± 0.082
σε2 0.737 ± 0.142 0.926 ± 0.178 0.967 ± 0.153 0.614 ± 0.118
r 0.015 ± 0.114 0.045 ± 0.117 n.e. 0.080 ± 0.120
d04 σα2 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000
σε2 0.929 ± 0.131 0.819 ± 0.115 0.876 ± 0.123 0.893 ± 0.126
r 0.000 ± 0.000 n.e. 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000
R06* σα2 0.198 ± 0.133 0.035 ± 0.077 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000
σε2 0.650 ± 0.135 0.557 ± 0.116 1.353 ± 0.232 0.813 ± 0.139
r 0.233 ± 0.137 0.059 ± 0.129 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000
ST σα2 0.106 ± 0.110 0.404 ± 0.143 0.000 ± 0.000 0.120 ± 0.138
σε2 1.172 ± 0.158 0.922 ± 0.124 0.912 ± 0.101 1.505 ± 0.203
r 0.083 ± 0.084 0.305 ± 0.088 n.e. 0.074 ± 0.083
X05 σα2 0.071 ± 0.120 0.013 ± 0.078 0.000 ± 0.000 0.041 ± 0.093
σε2 0.928 ± 0.178 0.664 ± 0.128 0.860 ± 0.136 0.734 ± 0.141
r 0.071 ± 0.119 0.019 ± 0.115 n.e. 0.053 ± 0.118
d14* σα2 0.304 ± 0.135 0.138 ± 0.092 0.162 ± 0.119 0.137 ± 0.085
σε2 0.575 ± 0.105 0.560 ± 0.102 0.767 ± 0.140 0.498 ± 0.091
r 0.346 ± 0.118 0.198 ± 0.119 0.174 ± 0.119 0.215 ± 0.120
I19* σα2 0.151 ± 0.121 0.219 ± 0.142 0.000 ± 0.000 0.145 ± 0.110
σε2 0.636 ± 0.136 0.648 ± 0.138 0.812 ± 0.142 0.563 ± 0.120
r 0.192 ± 0.140 0.253 ± 0.141 n.e. 0.205 ± 0.140
Q14* σα2 0.373 ± 0.148 0.149 ± 0.116 0.000 ± 0.000 0.022 ± 0.089
σε2 0.584 ± 0.103 0.802 ± 0.142 1.040 ± 0.151 0.810 ± 0.143
r 0.389 ± 0.112 0.157 ± 0.114 n.e. 0.027 ± 0.106
R13* σα2 0.517 ± 0.232 0.162 ± 0.216 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000
σε2 0.657 ± 0.140 1.388 ± 0.296 1.284 ± 0.225 1.217 ± 0.214
r 0.440 ± 0.132 0.105 ± 0.135 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000
S10* σα2 0.381 ± 0.171 0.239 ± 0.124 0.000 ± 0.000 0.083 ± 0.087
σε2 0.552 ± 0.113 0.498 ± 0.102 1.012 ± 0.170 0.550 ± 0.112
r 0.408 ± 0.129 0.324 ± 0.133 n.e. 0.131 ± 0.131
Y18 σα2 0.061 ± 0.112 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000 0.000 ± 0.000
σε2 0.872 ± 0.168 1.155 ± 0.183 0.957 ± 0.151 1.381 ± 0.219
r 0.065 ± 0.119 n.e. n.e. 0.000 ± 0.000
Overall σpro2 0.022 ± 0.018 0.032 ± 0.021 0.016 ± 0.012 0.014 ± 0.012
σα2 0.182 ± 0.039 0.129 ± 0.036 0.000 ± 0.000 0.037 ± 0.033
σε2 0.798 ± 0.044 0.838 ± 0.047 0.983 ± 0.045 0.947 ± 0.053
r 0.182 ± 0.036 0.129 ± 0.035 0.000 ± 0.000 0.037 ± 0.033
*

Provenances that were grouped into the SubsetQD for additional association analysis.

σpro2 - Variance among provenances; σε2 – Variance within groups; σα2 – variance among groups. Boldface indicates significant repeatabilities.