Skip to main content
. 2018 Mar 15;7:e32467. doi: 10.7554/eLife.32467

Table 1. geCAI values for each codon for logarithmically growing procyclic form T. brucei.

Amino acid Codon geCAI codon weight Amino acid Codon geCAI codon weight
A GCA 0.55 N AAC 1.00
A GCG 0.33 N AAT 0.55
A GCC 0.32 P CCC 0.82
A GCT 0.21 P CCA 0.61
C TGC 0.20 P CCG 0.34
C TGT 0.02 P CCT 0.26
D GAC 0.78 Q CAA 0.93
D GAT 0.45 Q CAG 0.51
E GAG 0.81 R CGC 0.63
E GAA 0.32 R AGA 0.50
F TTC 0.58 R CGT 0.22
F TTT 0.15 R CGA 0.17
G GGA 1.00 R CGG 0.08
G GGG 0.58 R AGG 0.06
G GGC 0.52 S AGC 0.19
G GGT 0.18 S TCA 0.18
H CAC 0.68 S TCC 0.16
H CAT 0.17 S TCG 0.15
I ATT 1.00 S TCT 0.13
I ATC 0.82 S AGT 0.04
I ATA 0.52 T ACG 1.00
K AAG 1.00 T ACC 0.93
K AAA 0.72 T ACA 0.78
L CTC 0.55 T ACT 0.66
L TTG 0.19 V GTG 0.25
L CTG 0.15 V GTT 0.15
L CTT 0.14 V GTC 0.13
L CTA 0.12 V GTA 0.12
L TTA 0.09 W TGG 0.22
M ATG 1.00 Y TAC 1.00
Y TAT 0.24