Skip to main content
. 2018 Apr 12;8:5900. doi: 10.1038/s41598-018-24371-6

Table 1.

Summary of the results of RT-qPCR tests: Cq-values of nucleoprotein gene and indicated subtypes for representative samples.

Sample ID AIV RT-qPCR (Cq values)
NP14 HA4plex PCR15 NA3plex PCR15 Duplex PCR
H1pdm H1av H1hu H3 N1 N2 N1-pdm H5 N1
Sw48 35.55 neg neg neg neg 33.0 neg neg 32.06 41.09
Sw49 28.75 neg neg neg neg 31.20 neg neg not done not done
Sw50 33.45 neg neg neg neg 35.63 neg neg 31.13 neg
Sw53 32.77 neg neg neg neg 34.79 neg neg 32.38 neg
Sw54 33.62 neg neg neg neg 33.27 neg neg 31.31 neg
Sw55 27.56 neg neg neg neg 36.40 neg neg 31.14 neg
Sw59 34.41 neg neg neg neg 35.56 neg neg 29.94 neg
Sw60 32.94 neg neg neg neg 27.40 neg neg 29.96 29.92
Sw61 34.25 neg neg neg neg 28.81 neg neg 30.39 31.39
Sw62 33.77 neg neg neg neg 31.73 neg neg 30.42 neg
Sw65 33.99 neg neg neg neg 33.67 neg neg 31.18 neg
Sw66 34.74 neg neg neg neg 34.10 neg neg 30.81 neg
Sw67 34.70 neg neg neg neg 29.27 neg neg 30.49 neg
Sw72 32.89 neg neg neg neg 34.79 neg neg 28.35 neg
Sw73 31.51 neg neg neg neg 31.72 neg neg 28.21 neg
Sw74 33.19 neg neg neg neg 32.59 neg neg 29.81 neg
Sw75 32.11 neg neg neg neg not done not done neg 28.55 neg
Sw77 32.46 neg neg neg neg 33.56 neg neg not done not done
Sw79 34.52 neg neg neg neg 33.56 neg neg 28.57 neg
Sw80 34.08 neg neg neg neg neg neg neg 28.10 neg
Sw81 33.41 neg neg neg neg 35.56 neg neg 28.25 neg
Sw84 33.66 neg neg neg neg 29.67 neg neg 29.67 neg
Sw85 34.03 neg neg neg neg 34.11 neg neg 28.49 neg