TABLE 2.
SNP genotypes identified from 815 isolates of S. enterica serovar Typhimurium and its monophasic variant from cattle between 1977 and 2017
| Yr of isolation | No. of isolates with indicated SNP genotype |
Total no. of isolates | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | ||
| 1977 | 1 | 1 | ||||||||
| 1980 | 2 | 2 | ||||||||
| 1981 | 1 | 1 | ||||||||
| 1982 | 4 | 4 | ||||||||
| 1983 | 1 | 1 | ||||||||
| 1984 | 1 | 3 | 4 | |||||||
| 1985 | 6 | 4 | 10 | |||||||
| 1986 | 1 | 8 | 1 | 10 | ||||||
| 1987 | 9 | 9 | ||||||||
| 1988 | 7 | 7 | ||||||||
| 1989 | 7 | 2 | 9 | |||||||
| 1990 | 1 | 4 | 5 | |||||||
| 1991 | 13 | 13 | ||||||||
| 1992 | 4 | 12 | 1 | 17 | ||||||
| 1993 | 27 | 3 | 30 | |||||||
| 1994 | 38 | 1 | 1 | 40 | ||||||
| 1995 | 22 | 2 | 24 | |||||||
| 1996 | 12 | 1 | 13 | |||||||
| 1997 | 21 | 21 | ||||||||
| 1998 | 19 | 1 | 1 | 2 | 23 | |||||
| 1999 | 28 | 1 | 1 | 30 | ||||||
| 2000 | 9 | 1 | 1 | 1 | 2 | 14 | ||||
| 2001 | 13 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 18 | |||
| 2002 | 13 | 1 | 3 | 10 | 27 | |||||
| 2003 | 18 | 3 | 3 | 12 | 37 | |||||
| 2004 | 8 | 2 | 19 | 1 | 30 | |||||
| 2005 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 46 | 2 | 57 | ||
| 2006 | 1 | 2 | 3 | 38 | 45 | |||||
| 2007 | 11 | 3 | 2 | 46 | 1 | 64 | ||||
| 2008 | 3 | 1 | 1 | 5 | 9 | 1 | 21 | |||
| 2009 | 2 | 1 | 2 | 1 | 4 | 4 | 14 | |||
| 2010 | 3 | 2 | 3 | 2 | 10 | |||||
| 2011 | 1 | 1 | 1 | 2 | 5 | |||||
| 2012 | 1 | 1 | 2 | 2 | 6 | 12 | ||||
| 2013 | 3 | 1 | 6 | 18 | 28 | |||||
| 2014 | 2 | 1 | 2 | 26 | 31 | |||||
| 2015 | 2 | 58 | 60 | |||||||
| 2016 | 3 | 7 | 5 | 54 | 69 | |||||
| 2017 | 3 | 3 | ||||||||
| Total | 261 | 90 | 12 | 1 | 11 | 39 | 192 | 33 | 176 | 815 |