. 2018 May 21;12:27. doi: 10.1186/s40246-018-0158-2

Table 8.

The expected accuracy results of the missense mutations of epidermal and hyperproliferative keratins in moderate psoriasis predicted as deleterious in PredictSNP and integrated tool

Gene	CDS mutation	AA mutation	Predict SNP		MAPP		PhD-SNP		PolyPhen-1		PolyPhen-2		SIFT		SNAP		PANTHER
Gene	CDS mutation	AA mutation	Prediction	Accuracy	Prediction	Accuracy	Prediction	Accuracy	Prediction	Accuracy	Prediction	Accuracy	Prediction	Accuracy	Prediction	Accuracy	Prediction	Accuracy
K14	c.388C > G	p.L130V	DEL	0.76	DEL	0.72	DEL	0.86	DEL	0.74	DEL	0.65	DEL	0.79	NEU	0.58	DEL	0.77
	c.415G > C	p.A139P	DEL	0.87	DEL	0.59	DEL	0.82	DEL	0.74	DEL	0.65	DEL	0.53	DEL	0.56	DEL	0.74
	c.419A > T	p.N140I	DEL	0.87	DEL	0.84	DEL	0.86	DEL	0.74	DEL	0.81	DEL	0.79	DEL	0.62	DEL	0.87
	c.442C > T	p.R148C	DEL	0.76	DEL	0.59	DEL	0.88	DEL	0.74	DEL	0.68	DEL	0.79	NEU	0.55	DEL	0.87
	c.512A > T	p.D171V	DEL	0.76	DEL	0.59	DEL	0.82	DEL	0.74	DEL	0.56	DEL	0.79	NEU	0.50	DEL	0.74
	c.519G > T	p.R173S	DEL	0.76	DEL	0.59	DEL	0.61	DEL	0.59	DEL	0.43	DEL	0.79	NEU	0.50	DEL	0.74
	c.904G > C	p.A302P	DEL	0.61	DEL	0.75	DEL	0.82	DEL	0.59	NEU	0.64	DEL	0.79	NEU	0.50	DEL	0.84
	c.1057G > C	p.A353P	DEL	0.61	DEL	0.57	DEL	0.86	DEL	0.74	DEL	0.47	NEU	0.74	NEU	0.61	DEL	0.68
	c.1234A > T	P.I412F	DEL	0.87	DEL	0.63	DEL	0.77	DEL	0.74	DEL	0.81	DEL	0.79	DEL	0.56	–	0.00
K10	c.479A > C	p.Y160S	DEL	0.87	DEL	0.86	DEL	0.86	DEL	0.74	DEL	0.81	DEL	0.79	DEL	0.72	–	0.00
	c.520C > A	p.L174M	DEL	0.76	DEL	0.72	DEL	0.59	DEL	0.74	DEL	0.65	DEL	0.79	NEU	0.55	DEL	0.72
	c.674A > C	p.D225A	DEL	0.87	DEL	0.66	DEL	0.68	DEL	0.74	DEL	0.68	DEL	0.79	DEL	0.56	DEL	0.77
	c.704G > T	p.R235M	DEL	0.76	DEL	0.59	DEL	0.82	DEL	0.74	DEL	0.81	DEL	0.79	NEU	0.55	DEL	0.78
	c.711G > T	p.K237N	DEL	0.76	DEL	0.75	DEL	0.88	DEL	0.59	DEL	0.63	DEL	0.79	NEU	0.50	DEL	0.74
	c.785T > A	p.L262Q	DEL	0.76	DEL	0.41	DEL	0.61	DEL	0.74	DEL	0.81	DEL	0.79	NEU	0.50	DEL	0.78
K16	c.410C > T	p.A137V	NEU	0.63	NEU	0.70	NEU	0.45	DEL	0.59	NEU	0.61	DEL	0.79	NEU	0.71	DEL	0.68
	c.583G > T	p.A195S	NEU	0.65	NEU	0.66	NEU	0.51	NEU	0.67	DEL	0.47	DEL	0.45	NEU	0.71	DEL	0.72
	c.589C > A	p.L197M	NEU	0.60	NEU	0.79	DEL	0.59	NEU	0.67	DEL	0.59	DEL	0.45	NEU	0.83	DEL	0.67
	c.634C > G	p.L212V	NEU	0.60	DEL	0.51	NEU	0.51	NEU	0.67	DEL	0.45	DEL	0.53	NEU	0.77	DEL	0.71
	c.667C > G	p.L223V	DEL	0.76	DEL	0.75	DEL	0.77	DEL	0.74	DEL	0.65	DEL	0.79	NEU	0.55	DEL	0.71
K17	c.503A > T	p.D168V	DEL	0.87	DEL	0.63	DEL	0.82	DEL	0.59	DEL	0.68	DEL	0.79	DEL	0.56	DEL	0.87
	c.662A > T	p.N221I	DEL	0.72	NEU	0.77	DEL	0.59	DEL	0.74	DEL	0.81	DEL	0.79	DEL	0.56	DEL	0.74
	c.682G > C	p.A228P	DEL	0.72	DEL	0.48	DEL	0.88	DEL	0.74	DEL	0.50	DEL	0.46	NEU	0.61	DEL	0.73
	c.907C > T	p.L303F	DEL	0.51	NEU	0.75	NEU	0.51	DEL	0.74	DEL	0.65	DEL	0.79	NEU	0.50	DEL	0.78
	c.986C > T	p.A329V	DEL	0.55	DEL	0.48	DEL	0.77	NEU	0.67	DEL	0.40	DEL	0.46	NEU	0.61	DEL	0.72
	c.1070G > T	p.R357L	DEL	0.72	DEL	0.77	DEL	0.68	DEL	0.59	NEU	0.68	DEL	0.79	DEL	0.56	DEL	0.76
	c.1144G > T	p.A382S	NEU	0.83	NEU	0.64	NEU	0.51	NEU	0.67	NEU	0.70	NEU	0.71	NEU	0.71	DEL	0.57
	c.1210A > C	p.T404P	NEU	0.63	DEL	0.51	DEL	0.68	NEU	0.67	NEU	0.71	NEU	0.65	NEU	0.50	NEU	0.48

DEL deleterious, NEU neutral