TABLE 2.
Accuracy of identification of nocardia
| Reference identificationa | No. (%) of isolates with indicated Vitek MS v3.0 ID result |
|||
|---|---|---|---|---|
| Correct to species level | Correct to complex or group level | Incorrect | No ID | |
| N. abscessus (n = 16) | 15 (94) | 1 (6) | ||
| N. arthritidisN (n = 6) | 1 (17) | 5 (83) | ||
| N. asiaticaN (n = 5) | 4 (80) | 1 (20) | ||
| N. beijingensisN (n = 1) | 1 (100) | |||
| N. brevicatena/paucivorans complex | ||||
| N. paucivorans (n = 18) | 18 (100) | |||
| N. nova complex | ||||
| N. nova (n = 33) | 33 (100) | |||
| N. veterana (n = 23) | 23 (100) | |||
| N. elegansN (n = 2) | 2 (100) | |||
| N. transvalensis complex | ||||
| N. transvalensis (n = 22) | 22 (100) | |||
| N. wallacei (n = 13) | 13 (100) | |||
| N. blacklockiaeN (n = 6) | 6 (100) | |||
| N. asteroides (n = 19) | 15 (79) | 3 (16) | 1 (5) | |
| N. cyriacigeorgica (n = 33) | 33 (100) | |||
| N. farcinica (n = 32) | 32 (100) | |||
| N. rhamnosiphilaN (n = 2) | 2 (100) | |||
| N. testaceaN (n = 1) | 1 (100) | |||
| N. brasiliensis (n = 37) | 35 (95) | 2 (5) | ||
| N. vulnerisN (n = 1) | 1 (100) | |||
| N. pseudobrasiliensis (n = 13) | 12 (92) | 1 (8) | ||
| N. mexicanaN (n = 1) | 1 (100) | |||
| N. otitidiscaviarum (n = 18) | 18 (100) | |||
| Nocardia species (n = 10) | 3 (30) | 7 (70) | ||
| Total (n = 312) | 236 (76) | 44 (14) | 10 (3) | 22 (7) |
a
A superscript “N” indicates species not included in the v3.0 database.