Table 3.

Network evaluations.

	Network 1	Network 2	Network 3	Network 4
Total genes	215	198	217	191
Genomic list	GWAS	GWAS-AC	GWAS	GWAS
Transcriptomic list	FFPE	FFPE	GSE10072	Common of FFPE & GSE10072
Core list	37	33	29	−
Largest network
Genes	46	43	46	40
Connections	70	62	69	58
Complexity	1.556	1.476	1.533	1.487
Gene ratio	0.214	0.217	0.212	0.209
Hub gene of largest network
ARNT	+	−	+	−
BCL6	−	+	−	−
CDH5	−	−	+	−
EDN1	+	+	−	+
EGFR	+	+	−	−
ENO1	−	−	+	−
EPAS1	+	+	+	−
ERG	−	−	+	−
FOS	+	−	+	+
HDAC4	+	+	+	+
HIF1A	+	+	+	+
MMP12	−	−	−	+
PARP1	+	+	−	−
TERT	+	+	−	−