Table 3.
Changes in noncoding RNA miRNA
Brain + 1 | Spleen + 1 | ||||||||
C vs T | C vs TE | C vs TEdM | C vs T | C vs TE | C vs TEdM | ||||
rno-miR-429 | 346.52 | 26.50 | 208.76 | rno-miR-451-3p | 3.70 | − 1.15 | 4.82 | ||
rno-miR-200b-5p | 99.01 | 7.42 | 127.07 | rno-miR-1949 | 1.78 | − 1.05 | 1.45 | ||
rno-miR-183-5p | 59.14 | 6.56 | 122.37 | rno-miR-6216 | 1.38 | − 1.22 | 1.30 | ||
rno-miR-182 | 56.38 | 1.00 | 43.57 | rno-miR-17-5p | 1.51 | − 1.13 | 1.52 | ||
rno-miR-96-5p | 48.13 | 1.00 | 61.72 | rno-miR-144-5p | 3.85 | 2.01 | 4.19 | ||
rno-miR-6216 | 2.67 | − 1.04 | 2.82 | rno-miR-484 | 1.52 | − 1.10 | 1.88 | ||
rno-miR-1193-3p | 1.34 | 1.03 | 1.20 | rno-miR-132-3p | 2.07 | 1.01 | 1.83 | ||
rno-miR-218a-2-3p | 1.24 | 1.07 | 1.30 | rno-miR-702-3p | 4.89 | 2.44 | 3.59 | ||
rno-miR-409a-5p | 1.85 | 1.04 | 1.84 | ||||||
rno-miR-92a-3p | 1.33 | − 1.08 | 1.29 | ||||||
rno-miR-339-5p | 1.39 | − 1.07 | 1.30 | ||||||
rno-miR-93-5p | 1.53 | 1.07 | 1.74 | ||||||
rno-miR-361-5p | 1.30 | − 1.01 | 1.50 | ||||||
rno-miR-31a-5p | 1.18 | − 1.13 | 1.30 | ||||||
rno-miR-21-3p | 1.29 | − 1.07 | 1.31 | ||||||
rno-miR-423-5p | 1.19 | − 1.10 | 1.26 | ||||||
rno-miR-210-3p | 1.35 | 1.11 | 1.45 | ||||||
rno-miR-532-3p | 1.25 | 1.11 | 1.26 | ||||||
rno-miR-103-3p | 1.18 | − 1.01 | 1.24 | ||||||
rno-miR-6319 | 1.39 | 1.12 | 1.27 | ||||||
rno-miR-378a-5p | 1.10 | 1.05 | 1.17 | ||||||
rno-miR-342-3p | 1.06 | − 1.05 | 1.09 | ||||||
Brain −1 | Spleen −1 | ||||||||
rno-miR-154-5p | − 1.48 | −1.17 | − 1.32 | rno-miR-708-3p | − 10.9 | 1.69 | − 1.39 | ||
rno-miR-7b | − 1.65 | −1.04 | − 1.80 | rno-miR-6329 | − 3.33 | − 1.07 | − 1.57 | ||
rno-miR-665 | − 2.57 | −1.11 | − 1.69 | rno-miR-148b-5p | − 1.22 | 1.14 | − 1.10 | ||
rno-miR-487b-3p | − 1.38 | 1.32 | − 1.54 | rno-miR-212-5p | − 1.44 | − 1.09 | − 2.17 | ||
rno-miR-672-3p | − 1.77 | 1.09 | − 1.41 | rno-miR-181a-1-3p | − 1.55 | 1.23 | − 1.16 | ||
rno-miR-10a-5p | − 1.47 | 1.29 | − 1.29 | rno-miR-1843b-5p | − 1.79 | 1.07 | − 1.37 | ||
rno-miR-770-5p | − 1.53 | 1.12 | − 1.60 | rno-miR-10a-5p | − 1.49 | 1.16 | − 1.22 | ||
rno-miR-666-5p | − 1.29 | 1.24 | − 1.32 | rno-miR-379-5p | − 1.92 | − 1.01 | − 1.32 | ||
rno-miR-29c-3p | − 1.52 | 1.07 | − 1.22 | rno-miR-411-5p | − 1.66 | − 1.12 | − 2.09 | ||
rno-miR-3594-3p | − 1.61 | − 1.04 | − 1.37 | rno-miR-192-5p | − 1.72 | 1.01 | − 1.80 | ||
rno-miR-485-3p | − 1.41 | − 1.13 | − 1.32 | rno-let-7f-5p | − 1.58 | 1.12 | − 1.20 | ||
rno-miR-139-3p | − 1.45 | 1.02 | − 1.27 | rno-miR-1b | − 1.53 | 1.14 | − 1.37 | ||
rno-miR-139-5p | − 1.54 | − 1.09 | − 1.41 | rno-miR-148a-3p | − 1.40 | − 1.10 | − 1.20 | ||
rno-miR-668 | − 1.19 | 1.12 | − 1.20 | rno-miR-126a-5p | − 1.46 | 1.09 | − 1.47 | ||
rno-miR-342-5p | − 1.15 | 1.10 | − 1.11 | rno-miR-28-5p | − 1.39 | 1.08 | − 1.30 | ||
rno-miR-344a-3p | − 1.18 | 1.01 | − 1.21 | rno-miR-204-5p | − 1.47 | 1.00 | − 1.20 | ||
rno-miR-330-3p | − 1.30 | − 1.05 | − 1.19 | rno-miR-181c-3p | − 1.67 | − 1.14 | − 1.42 | ||
rno-miR-1843a-3p | − 1.13 | 1.01 | − 1.16 | rno-miR-3068-3p | − 1.58 | − 1.08 | − 1.24 | ||
rno-miR-328a-3p | − 1.18 | − 1.08 | − 1.18 | rno-miR-30c-5p | − 1.41 | 1.03 | − 1.15 | ||
rno-miR-27a-3p | − 1.16 | 1.06 | − 1.21 | ||||||
rno-miR-139-5p | − 1.33 | − 1.07 | − 1.24 | ||||||
rno-miR-140-5p | − 1.30 | 1.06 | − 1.25 | ||||||
rno-miR-337-5p | − 1.42 | − 1.05 | − 1.34 | ||||||
rno-miR-30a-5p | − 1.16 | 1.03 | − 1.08 | ||||||
rno-miR-150-5p | − 1.29 | − 1.10 | − 1.16 | ||||||
rno-miR-147 | − 1.12 | 1.04 | − 1.09 | ||||||
rno-miR-30e-5p | − 1.24 | − 1.08 | − 1.14 | ||||||
ncRNA including snoRNA, snRNA | |||||||||
Brain + 1 | Brain − 1 | ||||||||
C vsT | C vs TE | C vs TEdM | C vsT | C vs TE | C vs TEdM | ||||
snRNA | U6 | 1.57 | 1.00 | 1.37 | snoRNA | SNORD42 | − 1.90 | − 1.24 | − 1.82 |
snoRNA | SNORD24 | 1.28 | 1.11 | 1.38 | lncRNA | PVT1 3 | − 1.98 | − 1.34 | − 2.18 |
snoRNA | SNORD60 | 1.25 | 1.00 | 1.22 | snoRNA | SNORA28 | − 1.29 | − 1.07 | − 1.97 |
snRNA | U6 | 1.09 | 1.00 | 1.06 | rRNA | Rnr2 | − 1.25 | − 1.07 | − 1.23 |
snoRNA | ACEA U3 | 1.64 | 1.05 | 1.59 | rRNA | Rnr2 | − 1.09 | − 1.10 | − 1.29 |
snoRNA | SNORA62 | 1.51 | − 1.04 | 1.27 | lncRNA | RMST 2 | − 1.19 | − 1.06 | − 1.13 |
snoRNA | SNORA73 | 1.39 | − 1.24 | 1.30 | |||||
snoRNA | SNORD62 | 1.76 | − 1.21 | 1.32 | |||||
snoRNA | SNORD15 | 3.17 | 1.38 | 3.12 | |||||
snoRNA | SNORA38 | 1.06 | − 1.00 | 1.06 | |||||
Spleen + 1 | Spleen − 1 | ||||||||
snoRNA | SNORD74 | 1.85 | − 1.39 | 1.52 | snoRNA | SNORA41 | − 3.84 | − 1.14 | − 1.85 |
snRNA | U6 | 1.67 | − 1.27 | 1.67 | snoRNA | SNORD33 | − 3.68 | − 1.64 | − 3.91 |
snoRNA | SNORD75 | 1.68 | − 1.03 | 1.50 | snoRNA | SNORA54 | − 3.49 | 1.06 | − 1.98 |
scRNA | 1.32 | − 1.23 | 1.14 | snoRNA | SNORD21 | − 3.48 | − 1.48 | − 3.88 | |
lncRNA | LOC100909539 | 1.37 | − 1.06 | 1.48 | snoRNA | SNORA71 | − 2.94 | − 1.55 | − 3.67 |
misc_RNA | 1.31 | 1.10 | 1.42 | vault_RNA | Vault | − 2.93 | − 1.49 | − 5.34 | |
lncRNA | Bc1 | 1.15 | 1.04 | 1.25 | snoRNA | SNORA11 | − 2.71 | − 1.08 | − 2.24 |