Table 1. AUPR and AUROC values of common GRN methods without noise.

Method	NET1		NET2		NET3		NET4		NET5
	AUPR	AUROC	AUPR	AUROC	AUPR	AUROC	AUPR	AUROC	AUPR	AUROC
BMALR	0.173	0.745	0.155	0.722	0.201	0.745	0.186	0.768	0.198	0.758
GINIE3	0.228	0.789	0.096	0.614	0.230	0.775	0.157	0.721	0.168	0.712
MRNET	0.143	0.584	0.075	0.579	0.124	0.683	0.128	0.708	0.095	0.611
ARACNE	0.165	0.634	0.108	0.611	0.174	0.679	0.143	0.709	0.154	0.621
BGRMI	0.245	0.804	0.118	0.71	0.185	0.696	0.213	0.784	0.154	0.643
CLR	0.179	0.782	0.109	0.635	0.238	0.787	0.154	0.712	0.163	0.705
G1DBN	0.089	0.589	0.055	0.612	0.155	0.678	0.153	0.705	0.117	0.631
NARROMI	0.122	0.713	0.105	0.665	0.192	0.706	0.167	0.713	0.186	0.727
TIGRESS	0.157	0.738	0.144	0.68	0.172	0.759	0.199	0.764	0.198	0.747
GENIRF	0.174	0.763	0.156	0.731	0.212	0.763	0.191	0.772	0.202	0.781
MIBNI	0.162	0.637	0.126	0.711	0.182	0.683	0.173	0.742	0.173	0.725
FBISC	0.167	0.635	0.173	0.598	0.263	0.65	0.228	0.664	0.206	0.685
CMI2NI	0.057	0.737	0.048	0.616	0.102	0.69	0.063	0.657	0.066	0.691
KFLR	0.194	0.812	0.195	0.823	0.235	0.803	0.236	0.813	0.221	0.797