Skip to main content
. 2018 Jul 18;9:2797. doi: 10.1038/s41467-018-05186-5

Table 1.

LASSO analysis of MreB’s role in modulating cylindrical uniformity

Symbola Strain 1 Strain 2 Predicted shape changeb Observed shape changec
Training
 □ ΔrodZ WT 0.109 0.101
 □ ΔrodZ+rodZ WT −0.022 0.000
 ∇ ΔrodZ+rodZ59-337 ΔrodZ+rodZ 0.036 0.051
 ∇ ΔrodZ+rodZ70-337 ΔrodZ+rodZ 0.082 0.076
 ∇ ΔrodZ+rodZ83-337 ΔrodZ+rodZ 0.059 0.073
 ∆ ΔrodZ+rodZ1-155 ΔrodZ+rodZ 0.012 0.005
 ∆ ΔrodZ+rodZ1-142 ΔrodZ+rodZ 0.040 0.045
 ∆ ΔrodZ+rodZ1-111 ΔrodZ+rodZ 0.077 0.070
 □ ΔrodZ+ pTrc99A WT 0.071 0.098
 ∇ ΔrodZ+rodZ59-337 ΔrodZ+ pTrc99A −0.062 −0.047
 ∇ ΔrodZ+rodZ70-337 ΔrodZ+ pTrc99A −0.016 −0.022
 ∇ ΔrodZ+rodZ83-337 ΔrodZ+ pTrc99A −0.039 −0.025
 ∆ ΔrodZ+rodZ1-155 ΔrodZ+ pTrc99A −0.086 −0.093
 ∆ ΔrodZ+rodZ1-142 ΔrodZ+ pTrc99A −0.057 −0.053
 ∆ ΔrodZ+rodZ1-111 ΔrodZ+ pTrc99A −0.020 −0.028
 □ MreBS14A WT 0.020 0.013
 □ MreBE143A WT 0.017 0.007
 □ MreBY183N WT 0.075 0.120
 □ MreBS14A ΔrodZ MreBS14A 0.028 0.012
 □ MreBE143A ΔrodZ MreBE143A 0.072 0.053
Testing
 • MreBE143A ΔrodZ+ pTrc99A MreBE143A ΔrodZ + MreBE143A 0.027 0.045

aSymbols used in Fig. 4 to show the different types of genetic perturbations included in the regression

bPredicted change in cell shape (ΔIDD = IDDstrain1 − IDDstrain2) is predicted from the regression model

cObserved change in cell shape is from 3D measurements of cells